diffEnrich：给定一个基因符号列表，执行差异富集分析

比较两组实验衍生的基因或蛋白质之间的功能富集（Peterson，DR.等人（2018））<doi:10.1371/journal.pone.0198139>. 给定一系列基因符号，“diffEnrich”将使用京都基因百科全书进行差异富集分析和基因组（KEGG）REST API。此软件包提供了以下功能用于管道中。简单地说，用户为人类、小鼠或大鼠提供KEGG格式的物种id，软件包将下载并清理特定物种的ENTREZ基因ID，并将其映射到各自的通过访问KEGG的REST API实现KEGG路径。KEGG的API用于确保KEGG提供最新的路径数据。接下来，用户将显著识别从两个基因集丰富路径，最后，用户将识别两个基因集之间差异富集的途径。除了在分析管道中，该包还提供了绘图功能。

版本：	0.1.2
取决于：	dplyr公司,ggplot2，R（≥2.10）
进口：	在这里，统计，爱尔兰航空公司,字符串,重塑2,gg新闻量表
建议：	针织物,rmarkdown公司,kableExtra（额外）,图表
出版：	2022-06-27
作者：	哈里·史密斯，劳拉·萨巴
维护人员：	哈里·史密斯
错误报告：	https://github.com/SabaLab/diffEnrich/issues网站
许可证：	GPL-2型
网址：	https://github.com/SabaLab/diffEnrich网站
需要编译：	不
材料：	自述文件 新闻
在视图中：	组学
CRAN检查：	diffEnrich结果

文档：

参考手册：	差异丰富.pdf
渐晕图：	diffEnrich示例

下载内容：

包源：	差异Enrich_0.1.2.tar.gz
Windows二进制文件：	r-预发布：diffEnrich_0.1.2.zip，r版本：diffEnrich_0.1.2.zip，r-oldrel：diffEnrich_0.1.2.zip
macOS二进制文件：	r-prerel（arm64）：diffEnrich_0.1.2.tgz，r-release（arm64）：diffEnrich_0.1.2.tgz，r-oldrel（arm64）：diffEnrich_0.1.2.tgz，r-prerel（x86_64）：差异Enrich_0.1.2.tgz，r-release（x86_64）：diffEnrich_0.1.2.tgz
旧资料来源：	diffEnrich存档

链接：

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