diathor:计算生态信息和基于硅藻的指数

计算样本中硅藻的生态信息和生物指数。它包括叶绿体多样性指数、大小等级、生态群和多种生物指数的数量/形状。它在定义的输出文件夹中输出包含所有结果的数据帧和所有获得数据的图。样本数据取自Nicolosi Gelis、Cochero和Gómez(2020年<doi:10.1016/j.ecolind.2019.105951>).该软件包使用“Diat”。Rimet&Couchez(2012<doi:10.1051/kmae/2012018>),以及B-Béres等人(2017年<doi:10.1016/j.ecolind.2017.07.007>).目前基于硅藻的生物指数包括Descy(1979<https://pascal-francis.inist.fr/vibad/index.php?action=getRecordDetail&idt=PASCAL8060205402>),Dell'Uomo的EPID索引(1996,ISBN:395009002),Prygiel&Coste的IDAP指数(1993<doi:10.1007/BF00028033>),Hürlimann&Niederhauser的ID-CH指数(2007<https://www.bafu.admin.ch/bafu/fr/home/themes/eaux/publications/publications-eaux/methodes-analyse-appreciation-cours-eau-diatomees.html>),Gómez和Licursi的IDP指数(2001年<doi:10.1023/A:1011415209445>), Leclercq&Maquet(1987<https://www.vliz.be/imisdocs/publications/286641.pdf>),Coste的IPS指数(1982年<https://www.oieau.org/eaudoc/notice/ETUDE-DES-METHODES-BIOLOGIQUES-DAPPRECIATION-QUANTITATIVE-DE-LA-QUALITE-DES-EAUX>), LOBO、Callegaro和Bender的LOBO指数(2002,ISBN:9788585869908),Sládeček(1986年<doi:10.1002/aheh.19860140519>), Kelly,&Whitton(1995<doi:10.1007/BF00003802>), Wood、Mitrovic、Lim、Warne、Dunlop和Kefford(2019年<doi:10.1016/j.ecolind.2018.12.035>),Castro Roa和Pinilla Agudelo的PBIDW指数(2014),以及Stenger-Kovácsa等人(2018年)的DISP指数。

版本: 0.1.0
取决于: R(≥2.10),字符串主义者,素食主义者,ggplot2,第三年
进口: 数据表,呜呜声,字符串,易怒的
建议: 针织者,rmarkdown公司
出版: 2022-03-16
作者: 玛丽亚·梅塞德斯·尼科洛西·盖利斯ORCID标识[aut],玛丽亚·贝伦·萨蒂奇ORCID标识[aut],约阿钦·科奇罗ORCID标识[创建]
维护人员: Joaquín Cochero在ilpla.edu.ar>
许可证: GPL-2型|GPL-3公司[扩展自:GNU通用公共许可证]
需要编译:
材料: 自述文件
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旧来源: 迪亚瑟档案

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