细胞测定仪:自动细胞测定门控和注释

假设细胞的双峰分布每个标记,算法构造一个二叉树,其节点为细胞亚群。在每个节点上,对观察到的细胞和标记进行建模通过一系列正态分布和一系列双峰正态混合分配。根据AIC的归一化差值进行拆分在这两个家庭之间。方法详见:康姆斯,阿尔哈辛,戈塔多,Hejblum和Thiebaut(2018)<doi:10.1002/cyto.a.23601>.

版本: 2.0.2
取决于: R(≥3.1.0),卢比(≥ 0.12.11)
进口: ggplot2、图形、,记录仪,麦克卢斯特,方法,统计信息,奶牛场,戈弗内尔
链接到: 卢比,RcppArmadillo公司
建议: 针织者,格式R,rmarkdown公司,翡翠色
出版: 2019-12-04
作者: 查里夫·阿尔卡西姆(Chariff Alkhassim)、鲍里斯·普·赫布卢姆(Boris P Hejblum)、安东尼·德沃(Anthony Devaux)、范洪·惠恩(Van Hung Huynh Tran)
维护人员: Boris P Hejblum<波尔多大学的Boris.Hejblum.fr>
错误报告: https://github.com/sistm/Cytometree/issues
许可证: LGPL-3型|文件许可证
需要编译:
引用: 细胞计数引文信息
材料: 自述文件 新闻
CRAN检查: 细胞检测结果

文档:

参考手册: 细胞仪.pdf
渐晕图: 使用“细胞树”执行自动门控的用户指南
“cytoftree”:将“cytomete”扩展到分析大规模细胞数据

下载内容:

包源: 细胞仪2.0.2.tar.gz
Windows二进制文件: r-devel公司:细胞仪2.0.2.zip,r版本:细胞仪2.0.2.zip,r-oldrel:细胞仪2.0.2.zip
macOS二进制文件: r释放(arm64):细胞仪2.0.2.tgz,r-oldrel(arm64):细胞仪2.0.2.tgz,r-release(x86_64):细胞仪2.0.2.tgz,r-oldrel(x86_64):细胞仪2.0.2.tgz
旧来源: 细胞仪档案

反向依赖关系:

反向进口: 氰化物过滤器

链接:

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