coala：一种聚结模拟框架

联合模拟器可以快速模拟生物序列根据给定的进化模型进化。您可以使用此软件包指定此类模型，以进行模拟并根据结果计算其他统计数据（Staab、Metzler、，2016 <doi:10.1093/bioinformatics/btw098>).它依靠现有的模拟器进行模拟，目前支持程序“ms”、“msms”和“scrm”。它还支持有限站点通过将模拟器与程序seq-gen相结合建立突变模型。Coala提供了计算某些汇总统计信息的功能也可以应用于实际的生物数据。导入数据的一种可能性是通过“PopGenome”包(<https://github.com/pievos101/PopGenome网站>).

版本：	0.7.2
取决于：	R（≥3.1.0）
进口：	断言(≥ 0.1),消化，方法，并行，R6级(≥ 2.0.1),卢比(≥ 0.11.0),再加热(≥ 3.0.0),供应链风险管理（≥1.6.0-2），统计，实用程序
链接到：	卢比,RcppArmadillo公司(≥ 0.3.810.0)
建议：	作业成本法(≥ 2.0),针织物，PopGenome（≥2.1.0），藻簇(≥0.1-16),rmarkdown公司,测试那个（≥0.11.0）
出版：	2024-03-04
作者：	保罗·斯塔布，德克·梅茨勒[aut，ths，cre]，豪尔赫·阿马亚·罗梅罗[ctb]
维护人员：	德克·梅茨勒（Dirk Metzler）
错误报告：	https://github.com/statgenlmu/coala/issues
许可证：	麻省理工学院+文件许可证
网址：	https://github.com/statgenlmu/coala
需要编译：	对
引用：	coala引文信息
材料：	自述文件 新闻
CRAN检查：	coala结果

文档：

参考手册：	coala.pdf格式
渐晕图：	使用Coala进行近似贝叶斯计算 将遗传数据导入Coala 示例 添加摘要统计信息和模拟器 使用外部模拟器 Coala简介

下载内容：

包源：	煤0.7.2.tar.gz
Windows二进制文件：	r-预发布：煤炭0.7.2.zip，r版本：煤炭0.7.2.zip，r-oldrel：煤炭0.7.2.zip
macOS二进制文件：	r-prerel（arm64）：煤0.7.2.tgz，r-release（arm64）：煤0.7.2.tgz，r-oldrel（臂64）：煤0.7.2.tgz，r-prerel（x86_64）：煤0.7.2.tgz，r-release（x86_64）：煤0.7.2.tgz
旧来源：	煤炭档案

反向依赖关系：

反向建议：

贾塔,鹿角兔

链接：

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