clustermole:无偏单细胞转录组数据细胞类型标识

将细胞类型标签分配给单细胞RNA测序(scRNA-seq)簇通常是一个耗时的过程,需要手动检查簇标记基因,并辅以详细的文献搜索。当出现意外或描述不清的人群时,这尤其具有挑战性。clustermole R包提供了查询来自各种数据库的数千个人类和小鼠细胞身份标记的方法。

版本: 1.1.1
取决于: R(≥4.3)
进口: 数字播放器,GSEA基地,GSVA公司(≥ 1.50.0),马格里特、方法、,爱尔兰航空公司,辛斯科,易怒的,第三年,实用程序
建议: 覆盖(covr),针织者,rmarkdown公司,氧气2,测试那个
出版: 2024-01-08
作者: 伊戈尔·多尔加列夫ORCID标识[aut,cre]
维护人员: 伊戈尔·多尔加列夫(Igor Dolgalev)<Igor.Dolgalev at nyumc.org>
错误报告: https://github.com/igordot/clustermole/issues
许可证: 麻省理工学院+文件许可证
网址: https://igordot.github.io/clustermole/
需要编译:
材料: 自述文件 新闻
在视图中: 组学
CRAN检查: 聚类分析结果

文档:

参考手册: 集群ole.pdf
渐晕图: clustermole简介

下载内容:

包源: 集群ole_1.1.1.tar.gz
Windows二进制文件: r-devel公司:clustermole_1.1.1.zip包,r版本:clustermole_1.1.1.zip包,r-oldrel:clustermole_1.1.1.zip包
macOS二进制文件: r释放(arm64):集群ole_1.1.1.tgz,r-oldrel(arm64):不可用,r-release(x86_64):集群ole_1.1.1.tgz,r-oldrel(x86_64):不可用
旧来源: clustermole存档

链接:

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