clusterhap:单倍型中的聚类基因型

一个单倍型是SNP的组合QTL(定量性状位点)内的(单核苷酸多态性)。clusterhap将一个群体中具有相同单倍型的所有个体组合在一起。每组都包含在每个SNP中具有相同等位基因的个体,是否缺少数据。因此,clusterhap将个人分组,被插补的基因具有相同等位基因的非零概率在整个SNP序列中。此外,clusterhap计算相对频率的概率。

版本: 0.1
取决于: R(≥2.10)
进口: 图形,实用程序
建议: 针织物rmarkdown公司测试那个
出版: 2016-05-16
作者: 加斯顿·奎罗和塞巴斯蒂安·西蒙迪Victoria Bonnecarrere和Lucia Gutierrez的捐款
维护人员: 加斯顿·奎罗(Gaston Quero)
许可证: GPL-3公司
需要编译:
CRAN检查: clusterhap结果

文档:

参考手册: 群集hap.pdf
渐晕图: 使用clusterhap

下载内容:

程序包来源: 集群hap_0.1.tar.gz
Windows二进制文件: r-devel公司:集群hap_0.1.zip,r版本:集群hap_0.1.zip,r-oldrel:集群hap_0.1.zip
macOS二进制文件: r释放(arm64):集群hap_0.1.tgz,r-oldrel(arm64):集群hap_0.1.tgz,r-release(x86_64):集群hap_0.1.tgz

链接:

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