cinaR:批量“ATAC-Seq”剖面的计算管道

批量“ATAC-seq”数据的差异分析和富集管道分析。此套餐将不同套餐组合在一起,形成终极套餐用于数据分析和“ATAC-seq”数据可视化。方法描述见“Karakaslar等人”(2021年)<doi:10.1101/2021.03.05.434143>.

版本: 0.2.3
取决于: R(≥4.0.0)
进口: ChIP寻求者,设计2,数字播放器,边缘R,fgsea公司,基因组范围,TxDb(发送日期)。哈皮恩斯。UCSC.hg38.known基因,TxDb(发送日期)。哈皮恩斯。UCSC.hg19.known基因,TxDb(发送日期)。姆穆苏卢斯。UCSC.mm10.known基因,ggplot2,gg排斥,gr设备,利马,实用程序,情势图,预处理核心,RColorBrewer公司,特别行政区,Writex(写入)
建议: 针织物,rmarkdown公司,降价
出版: 2022-05-18
作者: Onur Karakaslar[aut,cre],Duygu Ucar公司ORCID标识[自动]
维护人员: Onur Karakaslar<eonurkara at gmail.com>
错误报告: https://github.com/eonurk/cinaR/issues/
许可证: GPL-3公司
网址: https://github.com/eonurk/cinaR/
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材料: 自述文件 新闻
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参考手册: 中国.pdf
渐晕图: 西奈

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macOS二进制文件: r-prerel(arm64):不可用,r-release(arm64):cinaR_0.2.3.tgz公司,r-oldrel(arm64):不可用,r-prerel(x86_64
旧资料来源: cinaR档案

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