ccRemover:消除单细胞RNA-序列的细胞周期效应数据

实现识别和删除的方法scRNA-Seq数据的细胞周期效应。的描述方法见Barron M.和Li J.(2016)<doi:10.1038/srep33892>. 识别和移除来自单细胞RNA测序数据的细胞周期效应。提交。与以前的方法不同,ccRemover实现了一种机制正式测试组件是否与细胞周期相关,因此虽然它通常能彻底消除细胞周期效应,但它能保持数据中感兴趣的其他特征/信号。

版本: 1.0.4
取决于: R(≥2.10.0)
进口: 统计,实用程序
建议: 针织物,rmarkdown公司
出版: 2017-08-19
作者: 李军[aut,cre],马丁·巴伦
维护人员: 李军(Jun.Li at nd.edu)
许可证: GPL-3公司
需要编译:
CRAN检查: ccRemover结果

文档:

参考手册: cc删除.pdf
渐晕图: 稀疏数据中心

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旧来源: ccRemover存档

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