斗篷：立体性和上位性的综合分析封闭群

多效性和表观性联合分析推断预测遗传变异和表型之间的网络。它可以与标准双亲群体和多亲群体，如如多样性爆发（DO）小鼠、协作交叉（CC）小鼠或拟南芥多亲本高代杂交群体塔利亚纳。它使用了多效性基因变异的互补信息不同表型解析等位基因间上位性相互作用模型。为此，cape将主要影响和交互系数从成对变量回归为直接影响参数。这些参数描述了等位基因如何在抑制方面相互影响以及基因变异如何影响表型。所有最终的相互作用被报告为成对的亲本等位基因。有关此包中使用的方法的详细描述请参阅以下参考资料。Carter，G.W.、Hays，M.、Sherman，A.和Galitski，T.（2012）<doi:10.1371/journal.pgen.1003010>.Tyler，A.L.，Lu，W.，Hendrick，J.J.，Philip，V.M.&Carter，G.W.（2013）<doi:10.1371/journal.pcbi.1003270>.

版本：	3.1.2
取决于：	R（≥3.6）
进口：	阿宾德，caTools（计算机辅助工具），公司，do并行，电动汽车驱动装置，foreach公司，在这里，记录仪，矩阵，情势图，普拉克马，传播，qtl，qtl2，qtl2转换，R6级(≥ 2.4.1),R彩色啤酒(≥ 1.1-2),倒退(≥ 1.3-21),形状（≥1.4.5）、统计、工具、实用程序，山药(≥2.2.1)
建议：	测试那个(≥ 2.3.2),针织物(≥ 1.29),市场营销，平行
出版：	2024-01-09
作者：	安娜·泰勒，杰克·爱默生，Baha El Kassaby【aut】，安·威尔斯[aut]，乔治·科利舍夫斯基[aut]，Vivek Philip[aut]，格雷戈里·卡特
维护人员：	安娜·泰勒<Anna.Tyler at jax.org>
许可证：	GPL-3公司
需要编译：	不
材料：	自述文件 新闻
CRAN检查：	cape结果

文档：

参考手册：	岬角.pdf
渐晕图：	cape：一个用于多效性和上位性联合分析的软件包

下载内容：

包源：	资本支出3.1.2.tar.gz
Windows二进制文件：	r-devel公司：斗篷_3.1.2.拉链，r版本：斗篷_3.1.2.拉链，r-oldrel：cape_3.1.2.zip包
macOS二进制文件：	r释放（arm64）：cape_3.1.2.tgz，r-oldrel（arm64）：cape_3.1.2.tgz，r-release（x86_64）：cape_3.1.2.tgz，r-oldrel（x86_64）：cape_3.1.2.tgz
旧来源：	海角档案

链接：

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