biometr：基因组数据检索

执行大规模基因组数据检索和功能注释检索。该软件包旨在为用户提供标准化的自动化基因组、蛋白质组、RNA、编码序列（CDS）、GFF和元基因组的方法从“NCBI RefSeq”、“NCBI-Genbank”、“ENSEMBL”检索，和“UniProt”数据库。此外，“BioMart”数据库的接口（Smedley等人（2009）<doi:10.1186/1471-2164-10-22>)允许用户检索基因组位点的功能注释。此外，用户可以下载整个数据库，例如作为“NCBI RefSeq”（普鲁特等人（2007年）<数字对象标识代码：10.1093/nar/gkl842>)，“NCBI编号”，“NCBI nt”、“NCBI-Genbank”（Benson等人（2013））<doi:10.1093/nar/gks1195>)等，只有一个命令。

版本：	1.0.7
取决于：	R（≥3.1.1）
进口：	生物反应器，生物串，卷曲，可开采的，jsonlite公司，数据表(≥1.9.4）中，数字播放器(≥ 0.3.0),阅读器(≥ 1.4.0),下载器(≥0.3),RCurl（RCurl）(≥ 1.95-4.5),XML格式(≥ 3.98-1.1),高温气冷堆（≥0.6.1），字符串(≥ 0.6.2),呜呜声，R.utils公司，喜熵，用r，英尺
建议：	针织物(≥ 1.6),rmarkdown公司(≥ 0.3.3),开发工具(≥ 1.6.1),测试那个，顺序，马格里特
出版：	2023-12-02
作者：	哈伊克·乔治·德罗斯特[aut，cre]，哈康·特杰尔德斯[aut，ctb]
维护人员：	哈伊克·乔治·德罗斯特（Hajk-Georg Drost）<Hajk-Georg.Drost at tuebingen.mpg.de>
错误报告：	https://github.com/ropensci/biomartr/issues网站
许可证：	GPL-2型
网址：	https://docs.ropensci.org/biomartr网站/，https://github.com/ropensci/biomartr网站
需要编译：	对
引用：	biomertr引文信息
材料：	自述文件 新闻
在视图中：	组学
CRAN检查：	bioratr结果

文档：

参考手册：	生物艺术家.pdf
渐晕图：	Ensemb BioMart示例 NCBI数据库检索 生物标记的功能注释 元基因组检索 序列检索

下载内容：

程序包来源：	生物标记1.0.7.tar.gz
Windows二进制文件：	r-devel公司：生物艺术家_1.0.7.zip，r版本：生物艺术家_1.0.7.zip，r-oldrel：生物艺术家_1.0.7.zip
macOS二进制文件：	r释放（arm64）：生物标记_1.0.7.tgz，r-oldrel（臂64）：生物标记_1.0.7.tgz，r-release（x86_64）：生物标记_1.0.7.tgz，r-oldrel（x86_64）：生物标记_1.0.7.tgz
旧来源：	生物标记档案

反向依赖关系：

反向进口：	ORFik公司
反向建议：	反驳，packFinder（包查找器）

链接：

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