TiPS:轨迹和系统发育模拟器

生成与人口动力学模型相关的随机时间序列和系谱。使用Gillespie精确和近似算法以及我们引入的一种新算法对时间序列进行了模拟,该算法使用这两种方法来优化模拟的时间执行。家谱是使用基于回溯时间的方法从轨迹模拟的。Danesh G等人(2022年)对方法进行了描述<doi:10.1111/2041-210X.14038>.

版本: 1.2.3
取决于: R(≥3.5.0)
进口: 图形、gr设备、,gtools(工具),内联、方法、,卢比(≥0.12.14),统计,字符串,实用程序
链接到: 卢比
建议: 针织物,rmarkdown公司,,测试那个(≥ 3.0.0)
出版: 2023-05-23
作者: Gonche Danesh[aut,cre,cph],艾玛·索尔尼尔,Olivier Gascuel【aut,cph】,Marc Choisy[aut,cph,ths],塞缪尔·阿里松[aut,cph,ths]
维护人员: Gonche Danesh<Gonche.Danesh at gmail.com>
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引用: TiPS引文信息
材料: 自述文件
CRAN检查: TiPS结果

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旧来源: TiPS存档

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