SITH:肿瘤内异质性的空间模型

实施癌症生长和突变的三维随机模型,类似于Waclaw等人(2015)所述的模型<doi:10.1038/nature14971>. 允许对模拟肿瘤进行交互式3D可视化。全面总结了肿瘤内突变体的空间分布。包含从生成的肿瘤创建合成序列数据集的函数。

版本: 1.1.0
取决于: R(≥3.6.0)
进口: 卢比(≥ 1.0.4),散点图3d、统计、图形、grDevices
链接到: 卢比
建议: rgl公司,迁移率,针织者,rmarkdown公司,测试那个
出版: 2021-01-05
作者: 菲利普·B·尼科尔
维护人员: 菲利普·尼科尔(Phillip B.Nicol)<philnicol740 at gmail.com>
错误报告: https://github.com/phillipnicol/SITH/issues网站
许可证: GPL-2型|GPL-3公司[扩展自:GPL(≥2)]
网址: https://github.com/phillipnicol/SITH网站
需要编译: 是的
材料: 新闻
CRAN检查: SITH结果

文档:

参考手册: SITH.pdf文件
守夜人: 用SITH模拟肿瘤的空间生长

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旧来源: SITH档案

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