QTL.gCIMapping:QTL全基因组复合区间定位

通过具有随机或固定QTL/QEI效应的普通或压缩方差分量混合模型进行多个数量性状位点(QTL)和QTL-by-environment interaction(QEI)定位。首先,检测基因组上的每个位置,以获得相对于基因组位置的负对数P值曲线。然后,将每个效应(加性或显性)曲线或每个位点曲线上的所有峰值视为潜在的主效应QTL和QEI,其所有效应都包含在一个多位点模型中,它们的效应通过回交和F2群体的最小二乘回归和经验贝叶斯(或自适应套索)估计,真QTL和QEI通过似然比检验确定。见Zhou等人(2022)<doi:10.1093/bib/bbab596>和Wen等人(2018)<doi:10.1093/bib/bby058>.

版本: 3.4
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链接到: 卢比
出版: 2022-02-24
作者: 周亚辉、张亚文、文阳军、王世波、张元明
维护人员: 张远明<soyzhang at mail.hzau.edu.cn>
许可证: GPL-2型|GPL-3公司[扩展自:GPL(≥2)]
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