OptCirClust:循环、周期或帧数据聚类:快速、最优、,和可复制

用于循环、周期或框架数据。这里介绍的算法基于最优框架聚类的核心算法已开发(Debnath&Song 2021)<doi:10.1109/TCBB.2021.3077573>.这些算法的运行时间是O(K N log ^2 N),其中K是数字集群的数量,N是循环数据点的数量。在桌面上使用单处理器内核的计算机,可以几秒钟内就组合成几个集群。可以应用这些算法描述沿环状DNA分子、环状RNA的事件细菌、叶绿体和线粒体。人们还可以将气候数据沿着任何给定的经度或纬度。定期数据聚类可以表示为循环聚类。这些算法提供了一般的高性能循环、周期或框架数据集群的解决方案。

版本: 0.0.4
进口: Ckmeans.1d.dp、图形、,倍体,卢比,Rdpack公司,统计,重塑2
链接到: 卢比
建议: ,ggplot2,针织物,rmarkdown公司,测试那个
出版: 2021-07-28
作者: 如来·德伯纳ORCID标识[自动],乔·宋ORCID标识[自动,创建]
维护人员: Joe Song<乔姆松在cs.nmsu.edu>
许可证: LGPL(≥3)
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引用: OptCirClust引用信息
材料: 自述文件 新闻
在视图中: 组学
CRAN检查: OptCirClust结果

文档:

参考手册: 光电集群.pdf
渐晕图: 环形基因组聚类
三种循环数据聚类算法的性能
最佳循环聚类教程
最佳框架聚类教程

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旧来源: OptCirClust存档

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