LEGIT:潜在环境与遗传干扰(LEGIT)模型
构建基因型x环境相互作用(GxE)模型,其中G是遗传变异(遗传分数)的加权和,E是加权使用交替优化算法的环境总和(环境得分)Jolicoeur-Martineau等人(2017)<arXiv公司:1703.08111>. 这种方法在很大程度上与仅包含单个的传统GxE模型相比,增强了预测能力遗传变异和单一环境暴露。尽管这种方法最初是为GxE建模而设计的,它很灵活,不需要使用遗传和环境变量。它还可以处理2个以上的潜在变量(而不仅仅是G和E)和三向互动或更多。LEGIT模型生产结果解释性强,参数效率高,甚至可以用于小样本(n<250)。确定交互类型的工具(有利灵敏度、素质压力或差异敏感性)遗传变异或环境的数量<arXiv:1712.04058>. 这个软件现在可以通过lme4包生成混合效果的LEGIT模型。
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