一种基于迭代剪枝的无监督聚类算法用于捕获种群结构。该版本支持可直接应用于SNP数据的序数数据,以确定精细的种群结构,并基于迭代剪枝主成分分析('ipPCA')算法构建,如Intarapanich等人(2009)所述<doi:10.1186/1471-2105-10-382>. “IPCAPS”涉及使用基于主成分多元高斯混合建模和“期望最大化”聚类的多重分裂的迭代过程,如Lebret等人(2015)所述<doi:10.18637/jss.v067.i06>. 在每次迭代中,还使用R包“KRIS”中的函数rubikclust()来识别粗略的簇和异常值。
请使用规范形式https://CRAN.R-project.org/package=IPCAPS链接到此页面。