ICDS:使用Omics识别癌症功能障碍亚通路数据
通过整合基因表达、DNA甲基化和拷贝数变化以及通路拓扑信息来识别癌症功能失调亚通路。1) 我们首先通过整合三种数据来计算基因风险评分:DNA甲基化、拷贝数变化和基因表达。2) 其次,我们使用贪婪搜索算法来识别识别分数局部最大的路径中的关键功能失调子路径。3) 最后,使用排列测试计算这些关键功能失调子通路的统计显著性水平。
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