HTSSIP:稳定同位素探测数据的高通量测序分析

用于分析高通量测序的功能稳定同位素探测(HTS-SIP)数据。分析包括高分辨率稳定同位素探测(HR-SIP),多窗口高分辨率稳定同位素探测(MW-HR-SIP),和定量稳定同位素探测(q-SIP)。

版本: 1.4.1条
取决于: R(≥3.4.0)
进口: 记录仪(≥ 1.1.2),(≥ 4.1),马格里特(≥ 1.5),字符串(≥1.2.0),普利尔(≥ 1.8.4),数字播放器(≥ 0.7.4),第三年(≥ 0.7.2),ggplot2(≥ 2.2.1),素食主义者(≥2.4.0),DESeq2公司(≥ 1.16.1),品学兼优(≥ 1.20.0),科诺克林(≥ 0.2.2),懒惰的(≥0.2.0)
建议: 测试那个,针织物,rmarkdown公司,do并行
出版: 2019-09-13
作者: 尼古拉斯·扬布拉特(Nicholas Youngblut),塞缪尔·巴内特[cre,ctb]
维护人员: 塞缪尔·巴内特(Samuel Barnett)<康奈尔大学seb369>
许可证: GPL-2型|文件许可证
需要编译:
引用: HTSSIP引文信息
材料: 自述文件 新闻
CRAN检查: HTSSIP结果

文档:

参考手册: HTSSIP.pdf文件
渐晕图: BD移位
HTSSIP简介
HTS-SIP数据模拟
MW-HR-SIP公司
β多样性排序
重型SIP
q-SIP
量化同位素掺入

下载:

程序包来源: HTSSIP_1.4.1.目标.gz
Windows二进制文件: r-预发布:HTSSIP_1.4.1.zip文件,r版本:HTSSIP_1.4.1.zip,r-oldrel:HTSSIP_1.4.1.zip文件
macOS二进制文件: r-prerel(arm64):HTSSIP_1.4.1.tgz公司,r-release(arm64):不可用,r-oldrel(arm64):HTSSIP_1.4.1.tgz公司,r-prerel(x86_64):HTSSIP_1.4.1.tgz公司,r-release(x86_64):不可用
旧来源: HTSSIP存档

反向依赖关系:

反向进口: SIP毫克

链接:

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