广义Umatrix:数据二维投影的可信可视化

投影是常用的降维方法,它在二维空间中表示高维数据。然而,当将输出空间限制为二维时,导致数据的二维散点图(投影),低维相似性并不强制表示高维距离[Thrun,2018]<doi:10.1007/978-3658-20540-9>. 这可能导致对基础结构的误解[Thrun,2018年]。通过3D地形图,广义Umatrix能够描述这些二维散点图的误差。该软件包来源于M.C.特龙的书:《通过自我组织和群体智能进行基于投影的集群》(2018)<doi:10.1007/978-3658-20540-9>用于降维方法的主要算法称为简化自组织映射,发表于<doi:10.1016/j.mex.2020.101093>.

版本: 1.2.6
取决于: R(≥3.0)
进口: 卢比(≥ 1.0.8),Rcpp并行(≥ 5.1.4),ggplot2
链接到: 卢比,RcppArmadillo公司,Rcpp并行
建议: 数据可视化,rgl公司,网格,mgcv公司,png公司,重塑2,领域,A分析,巧妙地,德尔迪尔、方法、,针织物(≥ 1.12),rmarkdown公司(≥ 0.9)
出版: 2023-05-30
作者: 迈克尔·特伦ORCID标识[aut,cre,cph],费利克斯·佩佩[ctb,ctr],蒂姆·施赖尔[ctb,ctr],路易斯·温克尔曼[ctb,ctr],奎琳·斯蒂尔[ctb,ctr],阿尔弗雷德·乌尔奇
维护人员: 迈克尔·特伦(Michael Thrun)<m.Thrun at gmx.net>
错误报告: https://github.com/Mthrun/GeneralizedUmatrix/issues网站
许可证: GPL-3公司
网址: https://www.deepbionics.org
需要编译:
系统要求: GNU品牌,pandoc(>=1.12.3,用于渐晕图)
引用: 通用Umatrix引文信息
材料: 自述文件
CRAN检查: 广义Umatrix结果

文档:

参考手册: 通用Umatrix.pdf
渐晕图: 用降维方法揭示投影的高维结构

下载内容:

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Windows二进制文件: r-预发布:通用Umatrix_1.2.6.zip,r版本:通用Umatrix_1.2.6.zip,r-oldrel:通用Umatrix_1.2.6.zip
macOS二进制文件: r-prerel(arm64):通用Umatrix_1.2.6.tgz,r-release(arm64):通用Umatrix_1.2.6.tgz,r-oldrel(arm64):通用Umatrix_1.2.6.tgz,r-prerel(x86_64):通用Umatrix_1.2.6.tgz,r-release(x86_64):通用Umatrix_1.2.6.tgz
旧来源: 通用Umatrix存档

反向依赖关系:

反向进口: 数据仿生群,基于投影的聚类
反向建议: FCPS公司

链接:

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