DGEobj:差异基因表达(DGE)分析结果数据对象
提供一个灵活的容器来管理和注释差异基因表达式(DGE)分析结果(Smythe等人(2015))<doi:10.1093/nar/gkv007>). DGEobj具有行(基因)、列(样本)、分析(矩阵n行)的数据槽通过m-samples维度)和元数据(没有键控到行、列或分析)。一组用于存放、查询和检索数据子集的辅助功能已提供工作流。属性用于捕获元数据,例如物种和基因模型,包括再现性信息,使得参与方可以访问DGEobj历史记录,以查看每个数据对象是如何创建的,或者被改进的。由于DGEobj是可定制和可扩展的,因此它不受限制RNA-seq分析类型的工作流程–它几乎可以容纳任何数据分析工作流,从按样本(列)的分析矩阵(行)开始。
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