DGCA:差异基因相关分析

对输入执行微分相关分析矩阵,具有设计矩阵指定的多个条件。包含过滤、处理、保存、可视化和解释差异的功能整个标识符空间中标识符对的相关性,或与关于一组特定的标识符(例如,一个)。还包含几个对集群(即模块)执行差分相关分析的函数或基因。最后,它包含生成经验p值的函数假设检验并调整它们以进行多重比较。尽管包装考虑到基因表达数据,它适用于其他类型的基因组数据,除了可能适用于来自其他字段。它在手稿中描述得更详细了介绍它,可在以下网站免费获得<doi:10.1186/s12918-016-0349-1>.

版本: 1.0.3
取决于: R(≥3.2)
进口: WGCNA公司,矩阵统计,方法
建议: 针织物,插补,gplots(gplots),氟多醇,测试那个,ggplot2,绘图仪,GOstats公司,HGNC助手,组织Hs.eg.db,注释Dbi,阿宾德,梅根纳,矩阵,doMC(美国国防部长办公室),记录仪,奶牛场,统计,实用程序
出版: 2023-03-15
作者: 张斌[aut],安德鲁·麦肯齐
维护人员: 安德鲁·麦肯齐
许可证: GPL-3公司
需要编译:
材料: 自述文件
CRAN检查: DGCA结果

文档:

参考手册: DGCA.pdf
渐晕图: 基本DGCA小品

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旧来源: DGCA存档

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