DCLEAR:基于距离的细胞谱系重建

基于距离的细胞谱系重建的R代码。我们的方法赢得了2020年艾伦研究所细胞谱系重建梦想挑战赛的次级挑战2和3。参考文献:Gong等人(2021)<doi:10.1016/j.cels.2021.05.008>,Gong等人(2022)<数字对象标识代码:10.1186/s12859-022-04633-x>.

版本: 1.0.13
取决于: R(≥4.1.0),张量流(≥2.2.0)
进口: 生物并行,数字播放器,矩阵,矩阵统计,,潘戈恩,卢比,记录仪、方法、,呜呜声,字符串,第三年,rBayesian优化,爱尔兰航空公司,生物遗传学
链接到: 卢比,RcppArmadillo公司
建议: 针织物,rmarkdown公司,降价
出版: 2023-09-14年
作者: Il-Youp Kwak【aut,cre】,武鸣宫[aut]
维护人员: Il-Youp Kwak<ikwak2 at cau.ac.kr>
许可证: GPL-3公司
网址: https://github.com/ikwak2/DCLEAR
需要编译:
材料: 自述文件
CRAN检查: DCLEAR结果

文档:

参考手册: DCLEAR.pdf文件
渐晕图: 亚挑战3预测
DCLEAR:基于距离的小区LinEAge重构加权汉明

下载内容:

包源: DCLEAR_1.0.13.tar.gz公司
Windows二进制文件: r-预发布:DCLEAR_1.0.13.zip文件,r版本:DCLEAR_1.0.13.zip文件,r-oldrel:DCLEAR_1.0.13.zip文件
macOS二进制文件: r-prerel(arm64):DCLEAR_1.0.13.tgz,r-release(arm64):DCLEAR_1.0.13.tgz,r-oldrel(arm64):DCLEAR_1.0.13.tgz,r-prerel(x86_64):DCLEAR_1.0.13.tgz公司,r-release(x86_64):DCLEAR_1.0.13.tgz
旧资料来源: DCLEAR存档

链接:

请使用规范形式https://CRAN.R-project.org/package=DCLEAR链接到此页面。