CNVScope:拷贝数变化关系数据的通用工具包分析和可视化

提供创建交互地图、发现CNV地图域(边缘)、基因注释交互以及创建这些CNV交互地图的交互式可视化的功能。

版本: 3.7.2
取决于: R(≥4.1.0),ggplot2
进口: 第三年,重塑2,马格里特,联合采编,闪亮的,RCurl(RCurl),foreach公司,基因组相互作用,矩阵,打开图像R,生物反应器,矩阵统计,普利尔,数据表,数字播放器,do并行,字符串,rtracklayer公司,Hmisc公司
建议: 针织物,遥控器,压水堆,复杂热图,rmarkdown公司、HiCseg、,记录仪,visNetwork(可视网络),绕圈子,巧妙地,交互集,基因组范围,基因组特征,I范围,rslurm公司,发光体,小贩,DT公司,登录中,热铺层,S4矢量,生物技术经理,闪耀(shinyjs),html工具,html小部件,基因组信息Db,英国基因组。哈皮恩斯。加州大学圣保罗分校hg19,易怒的,冰沙
出版: 2022-03-30年
作者: James Dalgeish、Wang Yonghong、Jack Zhu、Paul Meltzer
维护人员: 詹姆斯·达尔格利什(James Dalgleish)
错误报告: https://github.com/jamesdalg/CNVScope/issues网站/
许可证: BSD_3_条款+文件许可证
网址: https://github.com/jamesdalg/CNVScope网站/
需要编译:
材料: 新闻
CRAN检查: CNV示波器结果

文档:

参考手册: CNV范围.pdf
渐晕图: 其他可视化示例
从公共数据创建TARGET输入矩阵
线性回归/后处理
功率分析

下载内容:

包源: CNV示波器_3.7.2.tar.gz
Windows二进制文件: r-预发布:CNVScope_3.7.2.zip,r版本:CNVScope_3.7.2.zip,r-oldrel:CNVScope_3.7.2.zip
macOS二进制文件: r-prerel(arm64):CNV范围_3.7.2.tgz,r-释放(扶手64):CNV示波器_3.7.2.tgz,r-oldrel(arm64):不可用,r-prerel(x86_64):CNV示波器_3.7.2.tgz,r-release(x86_64):CNV示波器_3.7.2.tgz
旧来源: CNVScope存档

链接:

请使用规范形式https://CRAN.R-project.org/package=CNVScope链接到此页面。