CKLRT:基于似然比的复合核机器回归测试
基于似然比检验(CKLRT)的复合核机器回归:在这个软件包中,我们开发了一个核机器回归框架,以对SNP集的整体遗传效应进行建模,同时考虑可能的GE相互作用。具体来说,我们使用复合核通过非参数函数来指定总体遗传效应,并在回归框架内对额外的协变量进行参数化建模。复合核被构造为两个核的加权平均值,一个对应遗传主效应,另一个对应GE相互作用效应。我们提出了一种似然比检验(LRT)和一种限制似然比检测(RLRT),用于统计显著性。我们推导了LRT和RLRT统计的有限样本分布的蒙特卡罗方法。(N.Zhao,H.Zhang,J.Clark,A.Maity,M.Wu。基于似然比检验的复合核机器回归,并应用于遗传和基因-环境交互效应(已提交)。)
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