CKLRT:基于似然比的复合核机器回归测试

基于似然比检验(CKLRT)的复合核机器回归:在这个软件包中,我们开发了一个核机器回归框架,以对SNP集的整体遗传效应进行建模,同时考虑可能的GE相互作用。具体来说,我们使用复合核通过非参数函数来指定总体遗传效应,并在回归框架内对额外的协变量进行参数化建模。复合核被构造为两个核的加权平均值,一个对应遗传主效应,另一个对应GE相互作用效应。我们提出了一种似然比检验(LRT)和一种限制似然比检测(RLRT),用于统计显著性。我们推导了LRT和RLRT统计的有限样本分布的蒙特卡罗方法。(N.Zhao,H.Zhang,J.Clark,A.Maity,M.Wu。基于似然比检验的复合核机器回归,并应用于遗传和基因-环境交互效应(已提交)。)

版本: 0.2.3
取决于: R(≥3.1.0)
进口: 卢比(≥ 0.12.17),mgcv公司,质量,国家实验室,编译器,统计信息
链接到: RcppEigen基因,卢比
出版: 2018-09-13
作者: 倪照[aut],张浩宇[aut,cre]
维护人员: 张浩宇<gmail.com>
许可证: GPL-3公司
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CRAN检查: CKLRT结果

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旧来源: CKLRT档案

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