AnaCoDa:使用贝叶斯分析平稳性下的密码子数据框架

是一组用于分析基因组规模密码子的模型使用贝叶斯框架的数据。提供可视化模型配件的例程和检查点。目前用于分析密码子选择的基因数据的已发表模型基于核糖体间接成本（ROC）的用法为：ROC（Gilchrist等（2015）<doi:10.1093/gbe/evv087>)和ROC（带φ）（华莱士和德拉蒙德（2013）<doi:10.1093/molbev/mst051>). 在添加的“AnaCoDa”包含三个当前未发布的模型。无感误差的一阶近似模型分析基因数据以选择针对的密码子使用无意义错误率。PA（暂停时间）和PANSE（暂停时间+无意义误差）模型使用核糖体足迹数据分析估计核糖体暂停时间（有和无）核糖体足迹数据的无意义错误率。

版本：	0.1.4.4
取决于：	R（≥3.3.0），卢比(≥ 0.11.3),VGAM公司、方法、，mvtnorm公司
链接到：	卢比
建议：	针织物,Hmisc公司,尾波,测试那个,l模型2,降价
出版：	2020-09-15
作者：	作者@R
维护人员：	塞德里克·兰德勒（Cedric Landerer）<Cedric.Landerer at gmail.com>
许可证：	GPL-2型|GPL-3公司【扩展自：GPL（≥2）】
网址：	https://github.com/clandere/AnaCoDa网站
需要编译：	对
在视图中：	贝叶斯主义者,组学
CRAN检查：	AnaCoDa结果

文档：

参考手册：	AnaCoDa.pdf公司
渐晕图：	分析密码子数据

下载：

包源：	AnaCoDa_0.1.4.4.tar.gz公司
Windows二进制文件：	r-预发布：AnaCoDa_0.1.4.4.zip公司，r版本：AnaCoDa_0.1.4.4.zip公司，r-oldrel：AnaCoDa_0.1.4.4.zip公司
macOS二进制文件：	r-prerel（arm64）：AnaCoDa_0.1.4.4.tgz公司，r-release（arm64）：AnaCoDa_0.1.4.4.tgz公司，r-oldrel（arm64）：AnaCoDa_0.1.4.4.tgz公司，r-prerel（x86_64）：AnaCoDa_0.1.4.4.tgz公司，r-release（x86_64）：AnaCoDa_0.1.4.4.tgz公司
旧来源：	AnaCoDa存档

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