生物大分子静电势建模的主要问题之一是它们的存在在给定离子强度的水中，它们的形状不规则。相应的分析溶液泊松-玻耳兹曼方程（PBE）不适用于此类情况，可以找到电位的分布仅在数字上。DelPhi于1986年在Barry Honig教授的实验室开发，是许多研究人员使用的第一个PBE求解器。DelPhi之所以广受欢迎，是因为它的速度、准确性（静电自由能的计算仅限于略微依赖于网格的分辨率）和处理极高网格尺寸的能力（大于1000 x 1000 x 1000）。当前版本附带OpenMP和MPI选项以及分布式内存。其他功能，如为不同的空间区域分配不同的介电常数（Fortran版本），基于高斯的平滑介电函数，计算Zeta电位，通过修改的Boltzmann因子模拟盐溶质和固体之间没有明显的边界也吸引了许多研究者。除了典型的电位图，DelPhi可以生成并输出计算出的介电常数或离子浓度分布，前提是生物医学界为他们的研究提供了额外的工具。新工具包括DelPhiPKa、DelPhiForce。BION和突变分析工具。DelPhi由克莱姆森大学的“DelPhi开发团队”维护和开发。Delphi参考文件见：论文。
请参考我们的维基百科页面以获取更多帮助。
转到DelPhi论坛
