UCL Camino扩散MRI工具包

Camino是一个用于扩散MRI处理的开源软件工具包。该工具包实现了标准技术,如扩散张量拟合、分数各向异性和平均扩散率映射、确定性和概率性追踪成像。它还包含更专业和尖端的技术,如蒙特卡罗扩散模拟、多纤维和HARDI重建技术、多纤维PICo、腔室模型以及轴突密度和直径估计。

Camino采用模块化设计,能够构建包含其他软件包模块的处理管道。该工具包主要是为unix平台设计的,其结构允许为批处理的处理管道编写简单的脚本。大多数用户使用linux、MacOS或在windows下运行的类似cygwin的unix模拟器。然而,核心代码是用Java编写的,因此很容易从其他平台和编程环境调用,例如在unix或windows下运行的matlab。

伦敦大学学院微观结构成像小组领导工具包的开发和维护。这个PICSL公司宾夕法尼亚大学的团队也做出了巨大贡献,曼彻斯特大学的杰夫·帕克和同事们也是如此。许多专家模块来自MIG和合作小组的研究。然而,该工具包还包括我们发现有用的文献中许多其他技术的实现。

我们希望你觉得卡米诺有用。我们欢迎您对工具包的任何补充意见、贡献或建议。

Camino是根据Artistic License 2.0发行的。许可证的全文是在这里.

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