这篇文章涵盖了三篇最近出版的具有共同主题的出版物，其作者是GtoPdb的合作者，因此使它们成为特别适合联合评论的三篇出版物。这些是：；人类信号系统的发现：肽与G蛋白偶联受体的配对[1], 实现肽GPCR脱蛋白的新方法[2] ，以及靶向G蛋白偶联受体的治疗性多肽研究进展[3].正如所料，这些都写得很清楚，包含有价值的细节，每个都包含自己的介绍。因此，这件作品不需要复习这些作品就其本身而言但只需指出它们的覆盖范围、应用领域，以及实体链接和/或外部查找选项的简要说明。
就背景而言，应该指出，GPCR去蛋白化的历史成功（即将其与生理相关的内源性配体重复配对）一直是困难和缓慢的。尽管几十年来，不仅所有主要制药公司，而且学术团体都在使用各种各样的去甲隐球菌筛查方法和技术，但情况依然如此。这与克隆（并申请专利）人类GPCR的全部功能同时进行，因为它们慢慢出现在人们的视野中。最初是在90年代中期通过挖掘数以百万计的表达序列标签（EST）转录本完成的，后来在1998年至2000年期间将重点转移到基因组DNA表面。从2000年汇编的下表中可以看出，即使在人类基因组草案完成之后，也取得了微小的进展[4]。
2019/20:G蛋白偶联受体简明指南概述了2000-2018年的进展(项目管理标识号：31710717)[5]和《药理学指南》最新切削列表.
作为这三篇论文中的第一篇，Foster等人[1]通过整合多肽-GPCR配对的计算和实验方法，在2019年显著推进了去甲藻化领域。他们从比较序列和结构分析开始，以获得对人类肽受体信号景观的生物学见解。然后，他们能够利用这些特征从整个人类基因组中挖掘候选肽配体，安排合成这些配体，然后在包括已知配体作为阳性对照的广泛配对分析中测试其活性。令人印象深刻的结果范围如下图7所示。
总之，本文首次报道的53个具有经验证的受体依赖性反应的肽，将已知的人类肽能信号网络从348个相互作用扩展到407个相互作用。还需要注意的是，他们无法在2004年至2016年的文献中复制至少六个报告的配对（即，无法验证这些去甲化）。
在与哥本哈根团队的合作下，GtoPdb团队根据他们的目标映射严格性和效力阈值策划了这篇论文。因此，有11个新的肽被注释为新去磷酸化受体的定量配体结合数据。以下是他们的PubChemSubstance链接（SID），其中GtoPdb公司（到目前为止）已成为这些复合结构（CID）的唯一来源超过730提交者。
在公共化学可以通过向下滚动到右下角的“相关信息”来访问PMID:31675498并单击“PubChem Substance”。每个条目都有一个从SID返回GtoPdb的指针，肽的命名法与论文中使用的命名法相匹配。然而，想要从GtoPdb中选择这些条目的用户可以转到配体搜索工具>通过文献参考搜索数据>输入PubMed Id:31675498>选择要搜索的字段：PubMed-Id。这将返回16个条目，因为它包括上述11个配体和5个受体，这些受体的结合数据是为其收集的（注：这些说明适用于旧的PubMed接口，因此其中一些可能会因新接口而改变）。而中的文章版本单元格期刊本身没有实体大纲（除了参考文献），PubMed Central版本已自动链接PDB ID。所有GPCR蛋白/基因名称都应该在GtoPdb中检索，当然GPCR数据库
三篇文章中的第二篇是Hauser等人[2]的综述。这包括了与上述相同的一些基础，但包括对当代去孤儿化方法的评估。信息丰富的图1总结了广泛的数据挖掘，如下所示。
除了指示GPCR的配体状态外，圆圈还延伸到临床相关性、疾病治疗潜力、出版物密度和工具化合物ChEMBL公司注意，虽然ChEMBL链接到具有广泛潜能的化合物，但GtoPdb对数量较少的候选探针有更严格的注释，包括最近的出版物（例如，上述11个配体不在ChEMBL26中）。
在BJP上发表的优点之一是为GtoPdb配体和靶点提供作者特定的外链（参见项目管理标识30087946).对于本文中提到的所有GPCR以及本次审查之前已经存在于GtoPdb中的任何配体，这些都已适当地添加到PDF中。下面显示了五个链接的示例。
点击“15加仑“因此，上面为我们提供了该受体的完整注释，包括下面显示的激动剂配体记录。
因此GPR15升（71-81）对应于SID 404859015号不幸的是，表1的格式排除了为新配体添加活性链的可能性。
这三者中的最后一个是Davenport等人[3]的深入综述，其中包括将调节GPCR的肽翻译为临床有效药物的方面。这甚至可能最终扩展到前两篇论文中肽的类似物，甚至可能与新的脱甲作用有关。如本综述所述，治疗性肽最近通过延长半衰期、缝合和抵抗蛋白水解而经历了技术复兴。这些措施改善了药物动力学和口服生物利用度，迄今为止，与传统小分子候选药物相比，这些药物对肽结构的益处要小得多。图1概述了这些肽批准和高级候选肽。
这篇综合综述接着详细描述了26种临床应用的合成肽（20种激动剂和6种竞争性拮抗剂），靶向8个A类受体家族。它还包括一个有用的结构观点，不仅涉及肽结合位点，还涉及与非天然氨基酸和化学修饰相关的经常被忽视的方面。
似乎有点不合时宜Nat Rev药物发现PDF是实体无链接区域（尽管展览会-已经向他们指出了差距）。尽管如此，GPCR名称应该从GtoPdb和GPCRdb中干净地检索。审查中的大多数肽名称也应从GtoPdb检索其配体条目，但最终将对其进行交叉检查，以解决歧义，并使用参考的结合数据添加新的开发候选。
这三篇论文构成了该领域的一个参考广泛的概述，也代表了肽及其类似物的“好消息”。尽管如此幻灯片集概述了管理肽和在数据库中搜索肽的一些挑战。
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评论人克里斯·索桑，爱丁堡大学研究员，TW2Informatics的所有者，NC-IUPHAR蛋白质酶和药物靶点与化学（DRUTACS）小组委员会主席，ORCID 0000-0001-9580-0446。作为利益声明（但不是冲突！）Chris很高兴成为Alex Hauser博士研究生的共同导师计算受体生物学
[1]人类信号系统的发现：肽与G蛋白偶联受体的配对Foster SR、Hauser AS、Vedel L、Strachan RT、Huang XP、Gavin AC、Shah SD、Nayak AP、Haugaard-Kedström LM、Penn RB、Roth BL、Bräuner-Osborne H、Gloriam DE。细胞。 201910月31日；179（4）：895-908.e21。doi:10.1016/j.cell.2019.10.10PMID:31675498。
[2] 实现肽GPCR脱蛋白的新方法Hauser AS、Gloriam DE、Bräuner-Osborne H、Foster SR杂志.20203月；177(5):961-968. doi:10.1111/bph.14950。Epub 2020年2月3日PMID:31863461。
[3]靶向G蛋白偶联受体的治疗性多肽研究进展Anthony P.Davenport AP、Scully CCG、de Graaf C、Brown、AJH、Maguire JJ。 Nat Rev药物发现(2020).https://doi.org/10.1038/s41573-020-0062-z。
[4] 基因组学对药物发现的影响.Beeley LJ，Duckworth DM，Southan C药物化学专业.2000；37:1-43. PMID:10845246
[5] 2019/20:G蛋白偶联受体药理学简明指南。Alexander SPH、Christopoulos A、Davenport AP、Kelly E、Mathie A、Peters JA、Veale EL、Armstrong JF、Faccenda E、Harding SD、Pawson AJ、Sharman JL、Southan C、Davies JA；CGTP合作者。杂志.201912月；176增刊1:S21-S141。doi:10.1111/bph.14748PMID:3170717。
