关于limmaGUI

limmaGUI是Gordon Smyth的图形用户界面利马包装(线性MicroArray数据模型)。它使用最先进的统计数据标准化微阵列数据、执行诊断图的技术并在复合物中发现差异表达基因实验设计。limma和limmaGUI都是R(右)包装。这个利马套餐优惠R用户的命令行界面。limmaGUI包,而不是对专家用户来说,limma功能强大,提供了一个简单的许多常用limma的点击式界面功能。

为了使用limmaGUI,您需要2.10.0兰特或更高版本,Tcl/Tk(千立方英尺/千立方英尺)8.3或稍后(ActiveTcl用于窗户芬克MacOSX的Tcl/Tk(X11)或合适的LinuxTcl/Tk(千立方英尺/千立方英尺)已安装从源代码或通过包管理器(例如RPM)您还需要利马、limmaGUI、,tkrplot、R2HTML和xtable R包。使用biocLite安装所有需要的软件包,如生物导体场地.limmaGUI已经在Windows 2000、Windows XP和Red Hat Linux上成功测试,以及在带有X11的Mac OSX上。

limmaGUI的一些屏幕截图

Weaver数据集。。。





来自漩涡数据集的差异表达基因。。。



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