快速形状计算热力学匹配器（TDM），使用运行时启发式进行概率形状分析。

它使用管道来计算精确的形状概率。

此管道包含以下三个步骤：

1.创建一组最可能的形状。

2.将形状字符串转换为ADP语法。

3.然后将每个ADP语法以C++程序的形式转换为TDM。

使用RapidShape启发式，运行时增益随序列长度增长。因此，我们首次能够分析超过400个核苷酸或更多的序列。取决于阿尔法-和以前的方法相比，RapidShapes明显加快了形状分析的速度。因此，概率形状分析在中等规模的应用中变得可行，例如筛选细菌基因组中的RNA转录物。

图1：显示RNA的形状和不同层次的抽象表示。抽象形状类有一个巨大的优势：许多相似的RNA形状可以组合成一个抽象形状类。抽象级别由数字定义，其中5是最抽象的级别，1是最不抽象的级别。RapidShapes使用此抽象来生成形状特定的热力学匹配器。