跳跃对齐（JAli）是一种比较蛋白质序列与蛋白质家族的对齐方法，由多重对齐表示。它还可以用于敏感蛋白质数据库搜索。算法是]史密斯-沃特曼算法的推广。
本项目包括三个部分：
贾利语-jali将蛋白质序列和a的多重比对作为输入蛋白质家族并计算序列和比对的跳跃比对。
jsearch（搜索）（没有可用的在线版本）-jsearch将蛋白质数据库作为输入以及一个蛋白质家族的多重比对，将数据库中的所有蛋白质与比对进行比较，然后以相对于所计算的跳跃对准分数的排序顺序输出所述数据库。
jscan公司（没有在线版本）-jscan将蛋白质序列和蛋白质序列多重比对数据库（PRODOM格式）。jscan为序列和数据库中的每个多重对齐，然后按排序顺序输出集群名称相对于计算的跳跃路线得分。
