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作者:S.Tippmann,J.Krueger

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微RNA是利用反义互补抑制特定信使RNA表达的短RNA序列。如果我们能够充分了解它们在体内的生物发生和功能,我们可能会预测更多以基因为目标,并对其进行注释,进而通过引入来消除不需要的、可能是病理性的基因人工miRNA基因。然而,这些小RNA的成熟似乎很复杂,因为所涉及的蛋白质数量取决于生物体,不同的程序似乎适用。曾经如此生物信息学研究已经开发了不同的方法来重建miRNA通路,并且部分已经成功了。已经发布了一些程序来预测整个基因组中可能存在的miRNA前体将成熟的miRNA与其相应的靶基因相匹配的算法。不幸的是,对这一步骤知之甚少介于两者之间的是将前体加工成成熟和功能性活性miRNA,因此只有很少的方法可以接近这个预测差距。根据一种中心miRNA处理酶的说法,试图弥合差距的工具是命名为“In-Silio-Dicer”。

InsilicoDicer屏幕截图

为了预测已知前体的成熟miRNA,In-Silio-Dicer采用了两种不同的方法单独地。有关这些方法的算法细节,请参阅参考资料。



请InSilicioDicer用户引用:
西尔维娅·蒂普曼 成熟miRNA的内在和外在预测,学士论文,比勒菲尔德大学,2005年
建造于2015年3月4日(1:086458915b0f)