CEGeD（计算进化基因组距离）计算反转距离，基因组的易位距离和双连接距离。基因组数据可以从文件中读取，也可以在程序中手动键入。比较如下以文本和图形显示，并可以保存到文件中。CEGeD是DCJ工具。

Double-Cut-and-Join操作首先由Yancopoulos等人引入。[颜：收件人：FRI:2005].更简单的处理方法和更简洁的模型，如【BEG：混合：STO:2006】，是在我们的CEGeD工具中实现。