西海岸校區建設指揮部成立於2017年3月，在學校西海岸校區規劃和建設領導小組領導下，負責西海岸校區建設工作。下設前期部、科技部、工程部和綜合部，現有工作人員19人。其主要職責是：

1. 認真貫徹執行國家有關基本建設的法律法規，按照“規範、優質、高效、安全、廉潔”的原則，建設西海岸校區。

2.負責西海岸校區校園規劃的編制、報批和備案工作。

3. 負責編制西海岸校區五年建設規劃和年度建設計畫。

4. 負責組織實施年度項目建設。

5. 負責工程建設的安全、質量、進度及投資管理。

6.負責編制西海岸校區建設的投資計畫和年度用款計畫，經學校準予後執行。

7.負責向學校黨委、教代會彙報西海岸校區建設規劃、質量、進度和財務預決算等工作。

8.負責與西海岸新區各有關組織的聯系與協調工作。

9. 在校長授權下，按照規定程式，代表學校簽訂各類契约或協定並加強監督和管理，維護學校利益。

10.負責西海岸校區基建檔案和基建統計工作。

11.負責西海岸校區規章制度建設並執行監督。

12. 負責指揮部工作人員的思想政治、廉政建設、考核評定等工作。

13. 完成上級和學校交辦的其他工作。