上海舊址（1947-1949）

青島原址（1949-1994）

青島現址創新科技大樓（1994-）

1946年8月籌建，1947年1月成立

農林部中央水產實驗所

1950年7月

中央人民政府食品工業部水產試驗所

1951年4月

中央人民政府農林部水產試驗所

1955年3月

中華人民共和國農業部水產試驗所

1956年10月

中華人民共和國水產部黃海水產研究所

1961年12月

中華人民共和國水產部海洋水產研究所

1971年6月

青島海洋水產研究所

1973年12月

山東省海洋水產研究所

1978年6月

國家水產總局黃海水產研究所

1982年10月

中國水產科學研究院黃海水產研究所