第一届，1999年10月5日-10日，主題（亮點）：中國高新技術產業發展的一個里程碑，出席的中央領導：中共中央政治局常委、國務院總理朱鎔基。
在首届高交會開幕式上，時任國務院總理的朱鎔基親自出席並宣佈“為了促進中國與世界各國的經濟技術合作，中國政府决定每年在深圳舉辦中國國際高新技術成果交易會”。
第二届， 2000年10月12日-17日，主題（亮點）： 擴大規模，積極探索 ，出席的中央領導：中共中央政治局委員、國務院副總理吳邦國。
第二届高交會於2000年10月11日－17日在擴建後的高交會展覽中心舉行。時任國務院副總理吳邦國出席了開幕式並致詞。第二届高交會的內容由高新技術成果展示與交易、高新技術專業產品展、高新技術論壇三大部分構成。專業產品展新增了“生物技術專業產品展”和“新材料專業產品展”兩個專業展。
第三届，2001年10月12日-17日，主題（亮點）：組織實力更强，專業主題更突出 ，出席的中央領導：中共中央政治局候補委員、國務委員吳儀 。
2001年10月12日至17日，第三届高交會在高交會展覽中心和深圳市市民中心舉行。時任國務委員吳儀出席了開幕式並致詞。第三届高交會的內容由高新技術成果交易、高新技術專業產品展示與交易、高新技術論壇三大部分構成。
第四届，2002年10月12日-17日 ，主題（亮點）：國際證券交易機构首次大規模在中國聚會， 出席的中央領導：中共中央政治局委員、廣東省委書記李長春 ，全國人大常委會副委員長周光召。
2002年10月12日至17日，第四届高交會在高交會展覽中心和深圳市市民中心舉行。時任全國人大常委會副委員長周光召出席了開幕式並致詞。第四届高交會依然由高新技術成果交易、高新技術專業產品展示與交易、高新技術論壇三大部分內容構成。
第五届，2003年10月12日-17日 ，主題（亮點）：著力營造更加安全舒適的展會環境， 出席的中央領導：中共中央政治局委員、國務院副總理吳儀 。
2003年10月12日至17日，第五届高交會在高交會展覽中心舉行。時任國務院副總理吳儀出席了開幕式並致詞。第五届高交會主要內容包括“高新技術成果交易”、“高新技術專業產品展”、“中國高新技術論壇”、“super-SUPE系列活動”及“不落幕的交易會”五大部份。
第六届，2004年10月12日-17日，主題（亮點）：“國際化”程度越來越高， 出席的中央領導：中共中央政治局委員、國務院副總理吳儀 。
第六届高交會在高交會的發展史上具有里程碑意義，使高交會實現了由初創到成熟的跨越。在仍使用高交會展覽中心的同時，第六届高交會主場成功移師新建的深圳會展中心，展覽總面積比上届新增了近3倍，達到135500平方米，為歷屆規模最大。
第七届，2005年10月12日-17日 ， 主題（亮點）：自主創新， 出席的中央領導：中共中央政治局委員、國務院副總理曾培炎 。
第七届届高交會是一次盛况空前、國際化和自主創新色彩濃厚的高科技盛會。來自世界各地的104個代表團、3464家參展商和1896家投資商參加了展示、交易和洽談。國外23個國家和國際組織、中國內地所有的36個省、自治區、直轄市、計畫單列市和26所高校以及港澳臺地區組團參展參會，國內外65家知名跨國公司參加了展示與交易，專業展海外展區面積所占比例達38%。
第八届，2006年10月12日-17日， 主題：自主創新迴圈經濟智慧財產權保護， 出席的中央領導：中共中央政治局委員、國務院副總理吳儀 。
第八届高交會是“十一五”規劃和全國科技大會做出自主創新戰略部署和十六届六中會會做出構建社會主義和諧社會重要决定後首度舉辦的高交會。從新形勢下的國家發展戰略出發，第八届高交會緊扣科技和經濟發展熱點，突出“自主創新、迴圈經濟、智慧財產權保護”三大主題，著力强化四大功能。
第九届，2007年10月12日-17日 ， 主題：推進開放創新保護智慧財產權創建和諧社會， 出席的中央領導：全國人大常委會副委員長蔣正華 。
第九届高交會在建設創新型國家的戰畧指引下，著力突出“推進開放創新”、“保護智慧財產權”、“創建和諧社會”三大主題，呈現出濃厚的“開放、創新、和諧”特色。國防科工委自上届高交會加入高交會主辦單位行列後，首次組團參展；推出了中美“1+3”系列活動。
第十届，2008年10月12日-17日， 主題：科技改善民生創新改變世界， 出席的中央領導：全國人大常委會副委員長桑國衛 。
第十届高交會是高交會舉辦十周年紀念，又恰逢北京奧運會的成功舉辦和我國改革開放三十周年，具有非同尋常的意義。作為一届承上啟下的展會，高交會組委會累十年之功，在總結前九届成功經驗的基礎上，以“科技改善民生、創新改變世界”為主題，再度實現新的創新與超越。
第十一届，2009年11月16日-21日 ，主題：創新·創業·發展， 出席的中央領導：全國人大常委會副委員長周鐵農 。
2009年是高交會新的十年發展的開局之年，作為高交會承前啟後跨越式發展的一届展會，第十一届高交會的舉辦具有重要的里程碑意義。
第十二届，2010年11月16日-21日， 主題：科技引領轉型創新驅動發展， 出席的中央領導：中共中央政治局委員、國務院副總理回良玉 。
第十二届高交會於2010年11月16-21日在深圳會展中心舉行，以“科技引領轉型創新驅動發展”為主題，在內容上設有“高新技術成果交易、高新技術專業產品展、中國高新技術論壇、super-SUPER專題活動、高新技術人才與智力交流會、不落幕的交易會”六大板塊，並首次啟用深圳會展中心多功能5號館為展覽場地。
第十三届，2011年11月16日-21日， 主題：促進國際創新合作加快發展管道轉變， 出席的中央領導：中共中央政治局委員、廣東省委書記汪洋 。
第十三届高交會深入貫徹落實科學發展觀，認真落實胡錦濤總書記今年8月份出席世界大學生運動會開幕式暨視察廣東重要講話精神，以“促進國際創新合作，加快發展管道轉變”為主題，取得了令人矚目的豐碩成果。
第十四届，2012年11月16日-21日， 主題：推進科技創新提升發展質量， 出席的中央領導：全國人大常委會副委員長路甬祥 。
第十四届高交會是一届貫徹落實黨的十八精神，突出創新驅動發展戰略的盛會。第十四届高交會以“推進科技創新，提升發展質量”為主題，通過一系列的展覽、論壇和活動，突出展示我國以創新驅動發展，取得了令人矚目的豐碩成果。
第十五届，2013年11月16日-21日， 主題：堅持創新驅動發展提高經濟增長質量， 出席的中央領導：中共中央政治局委員、國務院副總理汪洋 。
第十五届高交會，參展商帶來的高新技術項目與產品數達3300項，其中，擁有自主知識產權的項目數為2071項，占比62.8%，涵蓋了節能環保、新一代資訊技術、生物、高端裝備製造、新能源、新材料、新能源汽車和現代農業等領域。
第十六届，2014年11月16日-21日， 主題：堅持創新驅動加快綠色發展， 出席的中央領導：中共中央政治局委員、國務院副總理劉延東 。
第十六届高交會總展覽面積達11.5萬平方米，共有包括37個外國團組在內的3016家展商參展，帶來的高新技術項目與產品數達3593項，涵蓋了節能環保、新一代資訊技術、生物、高端裝備製造、新能源、新材料、新能源汽車和現代農業等領域。來自83個國家和地區、123個代表團在內的54.6萬人次參會。
第十七届，2015年11月16日-21日， 主題：創新創業跨界融合， 出席的中央領導：中共中央政治局委員、廣東省委書記胡春華 。
第十七届高交會以“創新創業跨界融合”為主題，總展覽面積達15萬平方米，有28個國家和地區的128個代表團、3686家參展商、16825個項目參加展示、交易和洽談，來自90個國家和地區的58.3萬人次觀眾參觀了主會場和分會場，214家海內外媒體的1496名記者參與了本届高交會的報導。
第十八届，2016年11月16日-21日， 主題：創新驅動質量引領， 出席的中央領導：中共中央政治局委員、廣東省委書記胡春華 。
第十八届高交會以“創新驅動質量引領”為主題，全方位展現我國促進創新創業、引領產業轉型陞級等方面的成果，積極發揮了推動國際科技交流合作，促進科技與經濟深度融合，促進新興產業的培育和發展，推動高新技術成果產業化的平臺作用，在高新技術領域的“行業風向標”、“科技風向標”、“創新風向標”的作用更加彰顯。
第十九届，2017年11月16日-21日， 主題：聚焦創新驅動提升供給質量， 出席的中央領導：中共中央政治局委員、廣東省委書記李希 。
第十九届高交會深入貫徹黨的十九大精神，根據改革攻堅和創新驅動發展戰略的各項要求，以“聚焦創新驅動，提升供給質量”為主題，積極組織卓有成效的展覽展示、會議論壇、交流活動等，發揮高交會在推動戰略性新興產業發展、推進大眾創業萬眾創新、深化和擴大國際科技和經濟交流合作等方面的積極作用。
第二十届，2018年11月14日-18日，主題：堅持新發展理念，推動高品質發展。出席的中央領導：中共中央政治局委員、廣東省委書記李希。
本届高交會以“堅持新發展理念，推動高品質發展”為主題，組織展覽展示、會議論壇、技術交流、合作洽談，努力發揮高交會在助推產業轉型陞級，深化國際科技交流合作，促進創新創業等方面的積極作用，進一步強化高交會“行業風向標”“科技風向標”“創新風向標”的作用。
第二十一届，2019年11月13日-17日，主題：共建活力灣區，攜手開放創新。出席的中央領導：全國人大常委會副委員長丁仲禮。
本届高交會以“共建活力灣區，攜手開放創新”為主題，組織展覽展示、會議論壇、技術交流、合作洽談等系列豐富多彩的活動，努力發揮高交會在提升科技創新能力、深化創新開放合作、促進創新成果轉化、營造良好創新環境等方面的積極作用，打造科技成果交流交易平臺，推動新時代科技創新工作高品質發展。
第二十二届，2020年11月11日-15日，主題：科技改變生活，創新驅動發展。出席的中央領導：中共中央政治局委員、廣東省委書記李希。
本届高交會以“科技改變生活，創新驅動發展”為主題，組織展覽展示、會議論壇、技術交流、合作洽談等系列豐富多彩的活動，努力發揮高交會在提升科技創新能力、深化創新開放合作、促進創新成果轉化、營造良好創新環境等方面的積極作用，打造科技成果交流交易平臺，推動新時代科技創新工作高品質發展。
第二十三届，線上展會時間為2021年12月27日-31日，線下展會時間為2021年12月27日-29日，線下展會地點為深圳會展中心（福田）、深圳國際會展中心（寶安），主題：推動高品質發展，構建新發展格局。
本届高交會安排有展覽、論壇、專業科技會議、活動、線上展會和分會場、專區等內容。其中，線下展覽總面積15.85萬平方米，共有4164家展商亮相線下展會和線上展會。
第二十四届，展會時間為2022年11月15日-19日，包括深圳會展中心（福田展區）和深圳國際會展中心（寶安展區）兩個展區，以及西麗湖論壇和人才高交會、應急安全科技展等分會場，主題：科技改革驅動創新，科技創新驅動發展。
本届高交會5671家展商亮相實體展會，帶來展覽和交易的項目8667項，其中1302項新產品和407項新技術首次亮相。
本届高交會以“激發創新活力提升發展質量”為主題，105個國家和地區團組、4000多家展商參展，展會總面積達50萬平方米，舉辦重大活動132場，發佈新產品新成果681項，17個央地合作項目現場簽約。本届高交會累計入場24.8萬人次，累計洽商交易金額372.79億元。
