旧第五高等学校化学实验场建于1889年,战后被熊本大学继承(重要文化遗产)。本实验场除了进行演示实验的阶梯教室(黑板后面是草案)之外,还有利用酒精灯燃烧引起的上升气流的排气系统的日本最古老的草案室也保留着原型。
旧第四高等学校物理化学教室建于1890年,战后被金泽大学继承,现在被移建、复原到博物馆明治村(注册有形文化财产)。建筑工程监理人为文部省工程师山口半六,设计者为文部省工程师久留正道,两人与旧第五高等学校化学实验场的设计者为同一人物,是本寺学校建筑的第一人。
这两个设施都是明治政府在中等、高等教育中极其重视包括实验在内的自然科学教育的珍贵史料。