京都大学化学研究所二木研究室川口老师

细胞内的输送效率和细胞的安全性
Syro I在发现兼顾的肽方面非常活跃

京都大学化学研究所二木研究室川口老师
京都大学化学研究所二木研究室

京都大学化学研究所二木研究室致力于设计在生物体内具有特异功能的肽。在少量多品种的肽合成中,由于活用了全自动并行肽合成装置Syro I,所以询问了川口老师、学生路边惇也、上畑佑介。

―请告诉我研究内容。

川口老师:
我们正在探索合适的肽来将蛋白质运送到细胞内。这项研究需要以膜伤害性肽为模板,网罗性地探索适当的肽序列,因此进行了少量多品种的肽合成。迄今为止的研究课题是,即使能很好地向细胞内输送蛋白质,毒性也很高。通过使用Syro I,可以简便地合成所有模式的肽,通过最近的研究成果,成功开发出了能够提高对细胞的安全性和蛋白质传递效率的肽。

那真是令人期待啊。我期待着今后的研究成果。请告诉我Syro I的导入经过。

川口老师:用户采访京都大学化学研究所川口老师
就任现职的时候已经导入了其他公司的全自动肽合成装置。当初使用的是那个,加热条件下的最低合成比例为300μmol,虽然适合大量合成,但我们要求的合成比例为数μmol,因此有点背离。另外还有可以并行合成8个检体的装置,因为是用粉体设置试剂的装置,所以试剂的浪费很少,但是对肽合成前的准备的负担很大。

路边先生:
因为每一个步骤都需要计量试剂并设置,所以很费事。例如10残基的合成时,每1步计量使用的各自的氨基酸和试剂,将其重复10次。这是根据合成根数,试剂计量成比例增加。

◆比起其他公司的产品,稳定运转和服务的可靠性是关键

原来如此,那可不得了啊。

川口老师:
现有的装置合成需要时间,合成数量有限制,在缓慢的进展中,因为得到了预算,所以决定重新研究导入少量多检体的并行合成装置。和刚才说的不同的制造商的装置,也有过去使用过的经验。虽然可以合成目的肽,但是在装置的运用和维护方面问题很多。发生流路堵塞等错误,有时会呼叫服务人员。贵公司的Initiator+Alstra和Syro I当时也在使用。由于这些设备使用方便,而且稳定性高,设备和服务都很可靠,所以从目前的研究主题和合成规模的观点出发,决定导入Syro I。

◆将文献的排列复制到记事本中,简单输入&防止操作错误

——请告诉我实际导入后感受到的好处。

川口老师:
京都大学化学研究所二木研究室的并行肽合成装置Syro I可以用溶液设置试剂进行合成是其优点。装置的试剂准备变得简单了。而且,由于装置的坚固性高,维护变得轻松了。因为现有的装置在合成后清洗整个系统的生产线消耗了大量的二氯甲烷,所以在溶剂成本和对环境的影响这一点上很在意。另外,每次合成都需要自我维护,容器也是专用的,必须再利用,所以需要仔细清洗。Syro I合成后的自我维护简单,输液管线也只需直接充满系统溶剂。清洗管线时也使用酒精溶剂,所以环境负荷很少。

路边先生:
合成中使用的所有试剂都可以用溶液准备,所以合成前的准备变得非常轻松京都大学化学研究所二木研究室学生做了。

到目前为止,每次合成都需要一个小时的额外时间来维护,但它没有了。另外,在制作排列和方法时,用键盘容易输入和能把排列写在记事本上是优点。其他公司设备必须用软件直接输入,所以在操作过程中容易输入错误。Syro I可以从参考文献复制到记事本中使用,所以不用担心输入错误。

用Syro I合成的肽几乎都能以高纯度合成。实验中使用的肽需要95%的纯度,所以合成后纯化的负担减轻了。

合成前和结束后变得相当轻松了呢。Syro I的运用实际上是怎样的?

路边先生:
合成的数量有1根的时候,也有10根以上的时候。合成水垢多为几mg水垢。实验中需要很多肽,合成收率不安的时候,为了确保产量准备了多个相同的序列来对应。氨基酸溶液等也可以将几次合成成分一起调制。也可以从该库存溶液中设置所需的量,也可以随时合成而不调制溶液。

——如果有改善点和要求的话,请告诉我。

川口老师:
因为从以前开始就使用Mac PC,所以如果软件支持Mac的话就太好了。

路边先生:
如果能自动将合成数组输入到要导入软件的文本文件中,我会很高兴。

谢谢您宝贵的意见。今后也请多多关照生物尾矿产品。今天在您百忙之中非常感谢。

采访实施:2023年10月3日
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部署产品

全自动并行肽合成装置
Biotage®Syro I

URL:https://www.biotage.co.jp/products_top/peptide-synthesis-purification/syro1/

使用单位

京都大学化学研究所二木研究室

https://www.scl.kyoto-u.ac.jp/~bfdc/index.html

我们的研究室从「化学」和「生物」的双方的视点设计在生物体内发挥出色的功能的分子,以控制对细胞的药物的取入·转印·向细胞内的信息传达等的独特的方法论的开发作为目标。