Features

基本卷的其他功能

基本卷不仅简单易用。后端构建坚固,可提供可扩展性,同时保证安全性。同时,也接受着定制的要求。虽然需要自己公司构筑,但由于成本、时间等资源,如果有没有实现的想法和项目,请务必咨询。

容量

基本卷构建为能够快速完成许多请求。

快速算法

大多数算法都被优化为并行运行,无论是10个还是10000个样本,分析时间都不会改变。如果是RNA-Seq的话30分钟左右,单电池RNA-Seq也会在几个小时内得到结果。为了快速获得结果,我们使用了多达32个内核、固态硬盘磁盘和具有增强网络的服务器。

可扩展性

Basepair构建用于处理大型基因组项目的工作量。基本pair缩放体系结构在用户请求新分析时启动服务器,在分析完成后自动关闭服务器。我们有能力运行数千台多核服务器,以支持最大的工作负载。

无限存储

在具有高级功能的AWS上运行,为用户提供安全、加密和耐用的事实上无限制的存储。自动保存原始数据、中间文件和最终结果。因为Basepair是基于Web的,所以只要有互联网访问,在世界各地都可以使用数据。

自定义

Basepair外观简单,但也支持从命令行使用和自动化。还可以集成管线。

关于自定义

管道

Basepair已经安装了GATK、Bowtie、MACS2、seurat等主要管线,如有需要,请务必通知我们。Basepair很重视用户的声音。到现在为止也从要求多的东西依次追加着。着急的话可以另外收费。它还支持nf-core和WDL,可满足您想要内置自己的工作流等要求(Professional/Enterprise许可证)。

自动化

GUI的优点是容易理解,可视性高,但是处理大量的样品反而会变得复杂。因此,Basepair实施了API。可通过Terminal(Mac)等使用CLI控制Basepair。

[关于自动化]

连接云

如果您已经在使用云(如AWS)或正在考虑今后使用云,则可以与基本pair合作(Professional/Enterprise许可证)。我们将其称为“连接云”,这意味着在用户身份验证和接口等构建复杂的部分使用基本pair可以快速进行服务。另外,存储(S3)和计算(EC2)可以利用自己的云,因此可以提高成本效率。

[体系结构]

[在AWS中使用NGS数据分析:第一次测序的生命科学组织的重要考虑事项]

白色标签

专业/企业许可证具有白标签选项。“白标签”是一种功能,可以消除基本pair品牌(如徽标),并将基本pair作为自己的品牌提供给自己的用户。

安全性和数据治理

Basepair运行的AWS符合HIPAA等高级安全隐私政策,Basepair也满足或超过了HIPAA GDPR的要求规格。

[关于安全性和数据治理]

加密

本公司符合或超过行业标准,保护数据不受恶意代理的侵害。我们的Web接口和API都只有https,这将加密您的计算机和我们的服务器之间的所有信息。所有数据将在存储期间加密。我们的服务器在安全防火墙内部运行。

隐私

我们理解你的数据非常宝贵。你可以完全控制谁可以访问自己的数据。只有您或其他明确允许查看或编辑数据的Basepair上的用户才能访问。

监视

在大型项目中,多个相关人员查看、添加和编辑数据。因为基本卷跟踪所有活动,所以您可以随时了解谁在什么时候做了什么。所有用户活动都是系统存储的,可用于审阅。在许多情况下,您可以根据需要回滚更改。

SLA(Service Level Agreement)

用户对关键项目非常信任Basepair,并对此负责。基本pair体系结构设计为坚固且容错。我们努力提供99.9%的可用性,在过去的12个月里99.8%,在过去的30天里100%完全发挥了作用。

6样品自由试验中

最多可以免费上传6个样品进行分析。对上传的样本的分析是无限制的。了解为什么世界顶级机构、实验室和制药团队使用Basepair节省数千美元。