自动化的ChiP-Seq峰值编码、对准和通路分析
在几小时内，而不是几天或几周内，你会得到可以出版的结果。基本pair的自动ChIP-Seq数据分析允许对准、读数（包括修剪和重复排除数）、峰值编码、通路增强分析、Motif分析和交互式绘图你可以接近出版。
什么是ChiP-Seq？
ChIP-Seq是指染色质免疫沉淀和后续的新一代测序（NGS）。这项技术用于找到DNA和蛋白质的结合，如转录因子结合位点、组蛋白修饰和开放的染色质区域。这些技术背后的核心思想是将目标表位交联和免疫沉降，然后对下拉式DNA进行测序。如果您想了解更多有关Chip-Seq的信息，请参阅分析教程来修改标记元素的显示属性。
使用Basepair管理ChiP-Seq数据
超高速
在并行处理的帮助下，基本卷可以从单个样例扩展到数千个样例。不需要编码。
出版准备完毕
从马上可用的ChiP-Seq分析管线中选择，然后单击“运行”，可以在几个小时内获得可出版的结果，而不是几天或几周。
可靠的结果
Basepair被顶级大学和审阅者的出版物使用，发表了大量使用本公司软件的研究。
包含在ChiP-Seq报告中的内容
ChiP-Seq管线包含常规选项，如对准、QC、读数、通路和Motif分析、峰值调用（包括峰值表和热图）。以下是可以立即在ChIP-Seq分析报告中使用的图形和交互式绘图的概要。
QC绘图
使用修剪前和修剪后的QC图表检查原始ChIP-Seq数据的质量。QC评分有助于澄清输入数据中的序列问题和污染。
读出计数流
读取计数流有助于提供在修剪、对齐和重复排除过程结束时可用的整个读取。请将此图作为数据分析的装配线。输入原始数据以获取可用读取输出。
基因组浏览器
使用Basepair内置的基因组浏览器，可以在鸟瞰图中看到原始基因组数据。我们的平台在内部处理所有转换，不需要额外的文件转换或软件就可以显示ChIP-Seq数据的视觉概述。
峰值编码和Motif分析
基本卷有助于轻松识别数据中的信号峰值。每个峰值都有启动子、内含子或基因之间的注释，显示相应的基因。关于找到的峰值，进行Motif分析，找到过剩存在的转录因子结合部位。
基因主体和转录起始部位的热图和轮廓
热图和复合轮廓汇总了转录起始位点（TSS）和带注释基因周围的数据。这使您能够直观地评估ChIP-Seq数据的整体质量，包括超出背景的目标浓缩，以及其与基因比较的结合模式。
6样品自由试验中
最多可以免费上传6个样品进行分析。对上传的样本的分析是无限制的。了解为什么世界顶级机构、实验室和制药团队使用Basepair节省数千美元。
