XHMM（eXome隐马尔可夫模型）

编写XHMM C++软件套件是为了调用下一代测序项目中的拷贝数变异（CNV），其中使用了外显子组捕获（或更普遍的目标测序）。

XHMM使用主成分分析（PCA）归一化和隐马尔可夫模型（HMM）检测和基因型拷贝数变异（CNV）读取目标测序实验的深度数据。

XHMM明确设计用于高覆盖率（至少60x-100x）的靶向外显子组测序，使用Illumina HiSeq（或类似）测序至少~50个样本。然而，XHMM的任何部分都没有明确要求这些特定的实验条件，只是许多样本的基因组区域的高覆盖率.