造成龟头炎的病因不同，其治疗的口服药物也不相同。如果是真菌感染造成的龟头炎，口服药物可选择伊曲康唑、氟康唑或者盐酸特比萘芬等，这些药物对真菌感染效果最好。如果是寄生虫感染造成的龟头炎，如滴虫性龟头炎，就需要针对寄生虫选择敏感药物治疗，如采用甲硝唑或替硝唑治疗滴虫性龟头炎。如果龟头炎是细菌感染造成的，就需要使用口服的抗生素治疗，比如喹诺酮类抗生素、头孢类抗生素、大环内酯类抗生素，代表的药物有左氧氟沙星胶囊、头孢克肟、阿奇霉素、红霉素等，效果都非常好。以上类型的龟头炎患者在治疗期间需要禁性生活，如果夫妻双方均有感染，需要一同治疗。此外，男性包皮过长或者包茎也可导致反复的龟头炎，急性期药物治疗可能有效，但是容易复发，建议急性期药物控制之后手术治疗。
