引起儿童出现发烧抽搐的患病原因，可能是由于宝宝的家族遗传因素，或者由于不良致病原感染导致的高热惊厥现象。一般情况下，小孩发烧抽搐与家族遗传因素有关，主要是大脑神经对发热的耐受能力低，一旦出现发烧，就有可能引发发烧抽搐现象。其次，当孩子感染相关病毒、细菌、肺炎支原体、真菌等致病原时，致病原也可直接感染中枢神经，或毒素损害中枢神经，就可能会引起孩子发烧抽搐情况。如果小儿自身患有小儿癫痫这类患病症状包括抽搐的疾病，小儿在患有发烧的患病症状时可能诱发癫痫病发作，出现抽搐的患病症状。
