脑血栓通常是由于患者自身的原因，或者继发性的栓塞导致血管出现狭窄、闭塞。该血管所支配的脑组织出现缺血、缺氧的改变，脑组织也可以出现缺血、软化以及坏死，从而产生临床症状。脑血栓形成和大血管动脉粥样硬化、小血管闭塞以及心源性栓子的形成、血液成分的改变及血液动力学的改变密切相关。脑血栓治疗，在急性期如果可以及时发现，通常可以行静脉或者动脉溶栓。如果错过了最佳的治疗时期，也可以使用抑制血小板聚集的药物，以及他汀类的药物，降低血液粘滞度，稳定斑块。
