扁桃体发炎，是腭扁桃体的，通常是急性的非特性的炎症。常继发上呼吸道感染，还伴有咽部黏膜和淋巴组织的急性炎症。乙型溶血性链球菌是主要的致病菌，还有一些是由葡萄球菌，肺炎球菌，流感嗜血杆菌等引起，另外一些病毒腺病毒，鼻病毒，单纯疱疹性病毒，也可以引起扁桃体的发炎。扁桃体的发炎除了病毒和细菌的因素之外，还跟自身免疫有关系，当患者的免疫力降低的时候，病原体可能会大量繁殖毒素可以破坏隐窝的上皮，细菌或者病毒会侵入扁桃体的实质发生感染，所以要增强免疫力，避免受凉，潮湿，过度劳累，避免饮酒过度及有害气体的刺激，还避免反复发生的上气道的感染。
