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参考：Yoon S等人（2005）使用零抑制二元决策图从基因表达数据中发现相干双聚类。IEEE/ACM跨计算机生物信息2(4):339-54

参考帮助

摘要

当一些基因具有多种功能并且基因表达测量的实验条件不同时，双聚类方法可以是一种非常有用的分析工具。这是因为与传统的聚类技术相比，双聚类方法侧重于寻找基因子集和实验条件子集，这些条件共同表现出一致的行为。然而，双聚类问题本质上很难解决，并且寻找具有高相干度的双聚类通常需要花费大量的计算成本。在这项工作中，我们提出了一种新的双聚类算法，该算法利用零抑制二进制决策图（ZBDD）数据结构来应对计算挑战。我们的方法可以找到满足特定输入条件的所有双聚类，并且可以扩展到实际的基因表达数据。我们还提供了实验结果，验证了该方法的有效性。

引用类型
期刊文章|研究支持，非美国政府
作者
Yoon S公司,纳迪尼C,贝尼尼L,De Micheli G公司
主照明用于
其他照明设备
审查对象

基因本体注释

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基因/复合物 限定符 基因本体术语 方面 注释扩展名 证据 方法 来源 分配时间 参考

表型注释

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基因 表型 实验类型 突变体信息 应变背景 化学品 细节 参考

疾病注释

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基因 疾病本体术语 限定符 证据 方法 来源 分配时间 参考

法规注释

使用表下方的下拉列表增加此页面上显示的总行数，或使用在表格右上角滚动页面，浏览表格页面；使用列右侧的箭头按该列排序的标题；要按特定的实验类型筛选表，请在“筛选”框中键入关键字（例如，“微阵列”）；使用下载按钮将此表下载为.txt文件，或单击分析以使用GO Term Finder、GO Slim Mapper、SPELL或YeastMine进一步查看和分析目标基因列表。

调节器 目标 方向 监管 发生时间 方法 证据

翻译后修改

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现场 修改 修饰符 参考

交互注释

遗传相互作用

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互动者 交互程序 阿勒 化验 注释 行动 表型 SGA分数 P值 来源 参考

物理交互作用

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互动者 互动者 化验 注释 行动 修改 来源 参考

功能补充注释

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基因 物种 基因ID 应变背景 方向 细节 来源 参考

发布的数据集

使用表下方的下拉列表增加此页面上显示的总行数，或使用在表格右上角滚动页面，浏览表格页面；使用列右侧的箭头按该列排序的标题；使用表格顶部的“筛选”框筛选表格；下载此表使用下载按钮作为.txt文件；

数据集 描述 关键词 条件数量 参考