参考:舍甫琴科A等人(2002年)通过串联亲和纯化和质谱法破译蛋白质复合物和蛋白质相互作用网络:分析视角。分子细胞蛋白质组学1(3):204-12

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摘要


我们采用串联亲和纯化和质谱相结合的方法来破译芽殖酵母中的蛋白质复合物和蛋白质相互作用网络。对53个基因进行表位标记,通过两步免疫亲和层析从全细胞裂解液中分离出它们的相互作用伙伴。38个诱饵共拖出220个相互作用伙伴,它们是19个功能不同的蛋白质复合物的成员。我们鉴定了四种在不同功能的复合物之间共享的蛋白质,从而绘制了蛋白质相互作用网络的片段。与全基因组双杂交筛选的结果一致性较差(14%的已鉴定相互作用因子重叠)表明这两种方法可以对蛋白质组内的物理相互作用提供互补的观点。

引用类型
比较研究|期刊文章
作者
舍甫琴科A,沙夫特D,罗格夫A,Pijnappel WW公司,斯图尔特空军,舍甫琴科A
主照明用于
其他照明设备
审查对象

基因本体注释


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基因/复合体 限定符 基因本体术语 方面 注释扩展名 证据 方法 来源 分配时间 参考

表型注释


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基因 表型 实验类型 突变体信息 应变背景 化学品 细节 参考

疾病注释


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基因 疾病本体术语 限定符 证据 方法 来源 分配时间 参考

法规注释


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调节器 目标 方向 监管 发生时间 方法 证据

翻译后修改


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现场 修改 修饰符 参考

交互注释


遗传相互作用

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互动者 互动者 阿勒 化验 注释 行动 表型 SGA得分 P值 来源 参考

物理交互作用

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互动者 互动者 化验 注释 行动 修改 来源 参考

功能补充注释


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基因 物种 基因ID 应变背景 方向 细节 来源 参考