*使用日志目录'/data/gannet/ripley/R/packages/tests-Supggests/pegas。重新检查'*使用开发中的R（不稳定）（2024-05-11 r86532）*使用平台：x86_64-pc-linux-gnu*R由编译一般合同条款-14（通用条款）14.1.0GNU Fortran（GCC）14.1.0*运行于：Fedora Linux 36（工作站版）*使用会话字符集：UTF-8*使用选项“--no-stop-on-test-error”*正在检查文件“pegas/DESCRIPTION”。。。好啊*这是“pegas”1.3版软件包*正在检查包命名空间信息。。。好啊*正在检查包依赖项。。。好啊*正在检查这是否是源包。。。好啊*正在检查是否存在命名空间。。。好啊*正在检查可执行文件。。。好啊*正在检查隐藏的文件和目录。。。好啊*正在检查可移植文件名。。。好啊*正在检查是否有足够/正确的文件权限。。。好啊*正在检查是否可以安装程序包“pegas”。。。[19s/51s]好的*使用的C编译器：“gcc-14（gcc）14.1.0”*正在检查包目录。。。好啊*正在检查“build”目录。。。好啊*正在检查DESCRIPTION元信息。。。好啊*正在检查顶级文件。。。好啊*正在检查遗留文件。。。好啊*正在检查索引信息。。。好啊*正在检查包子目录。。。好啊*正在检查代码文件中的非ASCII字符。。。好啊*正在检查R文件的语法错误。。。好啊*正在检查包是否可以加载。。。好啊*正在检查是否可以使用声明的依赖项加载包。。。好啊*正在检查包是否可以干净地卸载。。。好啊*正在检查命名空间是否可以加载声明的依赖项。。。好啊*正在检查命名空间是否可以完全卸载。。。好啊*正在检查加载，而不在库搜索路径上。。。好啊*正在检查S3注册的使用。。。好啊*正在检查R代码中的依赖项。。。好啊*正在检查S3泛型/方法一致性。。。好啊*正在检查替换功能。。。好啊*正在检查外部函数调用。。。好啊*正在检查R代码是否存在可能的问题。。。[39s/138s]好的*正在检查Rd文件。。。好啊*正在检查Rd元数据。。。好啊*正在检查Rd线宽。。。好啊*正在检查Rd交叉引用。。。好啊*正在检查缺少的文档条目。。。好啊*正在检查代码/文档不匹配。。。好啊*正在检查Rd\用法部分。。。好啊*正在检查Rd内容。。。好啊*正在检查示例中未声明的依赖项。。。好啊*正在检查“data”目录的内容。。。好啊*正在检查数据中的非ASCII字符。。。好啊*正在检查ASCII和未压缩存储的数据。。。好啊*正在检查C/C++/Fortran源代码/标头中的行尾。。。好啊*正在检查Makefiles中的行尾。。。好啊*正在检查Makevars中的编译标志。。。好啊*正在Makefiles中检查GNU扩展。。。好啊*正在检查$（BLAS_LIBS）和$（LAPACK_LIBS。。。好啊*正在检查Makefiles中PKG_*FLAGS的使用。。。好啊*正在检查Makefiles中SHLIB_OPENMP_*FLAGS的使用。。。好啊*正在检查C/C++标头和代码中的杂注。。。好啊*正在检查使用的编译标志。。。好啊*正在检查编译的代码。。。好啊*正在检查“inst/doc”下PDF文件的大小。。。好啊*正在从“inst/doc”检查已安装的文件。。。好啊*正在检查“vignette”中的文件。。。好啊*正在检查示例。。。[6s/18s]错误在“pegas-Ex.R”中运行示例失败错误最有可能发生在：>###名称：hap.div>###标题：单倍型多样性>###别名：hap.div hap.div.单倍型hap.div-DNAbin>###关键词：操纵> >###**示例> >数据（鼠标）>hap.div（木鼠）#所有单倍型都是唯一的[1] 1> >##2009年H1N1数据中的神经氨酸酶序列（与adegenet一起交付）：>fl<-system.file（“files/pdH1N1-NA.fasta”，package=“adegenet”）>H1N1.NA<-读.dna（fl，“fasta”）文件中的警告（con，“rb”）：文件（“”）仅支持open=“w+”和open=“w+b”：使用前者readBin（file，“raw”，file.size（file））出错：只能从二进制连接读取调用：read.dna->read。FASTA->readBin执行已停止*正在检查渐晕中未声明的依赖项。。。好啊*正在检查程序包渐晕图。。。好啊*检查渐晕图输出的重建。。。[23s/78s]正常*正在检查手册的PDF版本。。。[12s/39s]正常*正在检查手册的HTML版本。。。[5s/14s]正常*正在检查目录中的非标准内容。。。好啊*正在临时目录中检查碎屑。。。好啊*已完成状态：1错误请参见'/data/gannet/ripley/R/packages/tests-Supggests/pegas。Rcheck/00check.log'了解详细信息。命令退出，状态为非零1时间：7:44.23134.14+14.32