含HDAC1:2的复合脱乙酰组蛋白

稳定标识符
R-HSA-3769447号
类型
反应[过渡]
物种
智人
隔间
审查状态
5/5
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概述
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HDAC1和HDAC2相互作用形成几种多亚单位复合物的催化核心,包括Sin3、核小体重塑脱乙酰酶(NuRD)和REST(CoREST)复合物的辅压子(Grozinger&Schreiber,2002)。HDAC1/2和组蛋白结合蛋白RBBP7(RbAp46)和RBBP4(RbAp48)的“核心复合物”已在体内和体外进行了描述(Zhang等人,1999年)。Sin3复合物由这个核心复合物加上SAP18和SAP30组成,这似乎有助于稳定蛋白质关联和Sin3A,Sin3A是复合物组装及其与各种DNA结合蛋白相互作用的支架(Ayer 1999)。哺乳动物表达两种Sin3蛋白,即Sin3A和Sin3B。公认的Sin3A核心复合物包含HDAC1-2催化核心、SAP18(Zhang et al.1997)、SAP30(Zhang et al.1998)、RBBP7/4(Ahringer 2000)、SUDS3(SAP45,SDS3)(Alland et al.2002)、ARID4B(SAP180)和SAP130(Fleischer et al.2003)。其他成员包括BRMS1(乳腺癌转移抑制因子1)、ARID4A(Rb-结合蛋白1)(Meehan等人2004年)和SAP30L(Viiri等人2006年)。Sin3A复合物通过RBBP7/4亚单位优先与低乙酰化组蛋白结合(Vermeulen等人2004年,Yoon等人2005年)。也可以通过ING1/2的H3K4-di/trimethyl标记招募到染色质中(Shi等人,2006年,Pena等人,2008年)。

Sin3B复合体与Sin3A复合体有一些共同的亚单位,但也可能包含不同的亚单位(Le Guezennec等人,2006a)。

NuRD复合物包含一个核心组蛋白脱乙酰酶复合物,该复合物由HDAC1-2催化核心加RBBP7(RbAp46)和RBBP4(RbAp48)组成(Ahringer 2000)。最大和关键的成分是Mi-2重塑亚单位(皮肌炎特异性自身抗原),它含有ATP酶/染色质重塑活性,并与其他成分有物理联系。哺乳动物有两种Mi-2蛋白:CHD3(Mi-2alpha)和CHD4(Mi-2beta)(Seelig等人,1996年)。CHD4(Mi-2β)是主要与NuRD复合体相关的形式(Zhang等人,1998年,Feng和Zhang,2001年),尽管CHD3是多种人类细胞系中NuRD复合物的成员(Le Guezennec等人,2006b)。尚不清楚CHD3和CHD4复合物之间是否存在功能差异(McDonel等人,2009年)。其他成分为MBD3(甲基CpG-结合域3)和转移相关(MTA)蛋白亚单位。MTA亚基(例如Mta1、Mta2或Mta3)似乎是互斥的,可能有助于NuRD复合物的功能多样性(Bowen等人2004,Fujita等人2004)。GATAD2A和GATAD2B蛋白(以前称为p66alpha和p66beta)通常被报告为NuRD的成员。MBD3可以被相关蛋白MBD2取代,形成MeCP1复合物(Feng&Zhang 2001,Le Guezennec等人,2006b)。MeCP1复合物仅占哺乳动物细胞中总NuRD复合物的一小部分(参考McDonel等人2009);MBD2已被证明对哺乳动物的正常发育是不可或缺的(Hendrich等人,2001年)。

NuRD通过MDB3招募用于DNA甲基化依赖性基因沉默。它与MeCP1(甲基CpG-结合蛋白1)和MeCP2结合,与DNA甲基化密切相关(Denslow&Wade 2007,Klose&Bird 2006)。

CoREST复合物至少包含HDAC1-2催化核心、REST(RE1-沉默转录因子)、RCOR1(CoREST,KIAA0071)和KDM1A(BHC110,LSD1)(Andres等人,1999年,Humphrey等人,2001年)。BRAF–HDAC(BHC)复合体由HDAC1-2、RCOR1、KDM1A、HMG20B(BRAF35)和PHF21A(BHC80)组成(Hakimi等人,2002年,Yang&Seto,2008年)。

该反应代表组蛋白的理论上完全脱乙酰化。
文献参考
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参与者
参与人员
催化剂活性

含HDAC1:2复合物[核质]的组蛋白脱乙酰酶活性

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