表面是一种仅给出性状数据和系统发育树来推断分支宏观进化适应性景观的方法。该名称是“表面使用状态拟合和AIC建模收敛演化”,该方法在R包中实现表面.
表面基于哎哟方法论(Butler和King,2004,Am.Nat.),该方法符合Ornstein-Uhlenbeck稳定选择模型,假设一个分支中的进化机制发生了变化。的新颖特征表面它使用逐步AIC构建了这样一个“Hansen”模型,没有任何被认为是收敛的分类群的先验规范。这允许对自适应峰值偏移进行客观搜索,并测试分支是否具有异常表型收敛的特征。
这些方法是与卢克·马勒,并进行了详细描述在这里并在Anolis蜥蜴收敛研究中实现在这里.R包表面实现此方法的CRAN(起重机)作为源文件或Windows或Mac二进制文件。表面包装包括一个小品,使用Sweave公司解释并演示了其最重要的功能;也可以从下面的链接下载包源代码和vignette。您还可以观看约8分钟视频教程关于表面YouTube频道《生态学与进化方法》。